James

Почему некоторые белки «используют» бета-структуру ствола вместо альфа-спиралей в трансмембранном пространстве?


Биохимия Белки Клеточная мембрана Биология

Большинство белков фиксируются в мембране альфа-спиралями. Но некоторые используют бета-бочки.

Википедия описывает бета-бочки, используемые для поринов, препротеиновых транслоказ и липокалинов. Для меня структура альфа-спирали спиральной катушки могла бы, несомненно, выполнять те же функции и учитывая огромное количество белков с использованием альфа-спиралей, возможно, некоторые из них существуют.

Поэтому мой вопрос двоякий:

  1. Являются ли эти функции эксклюзивными для бета-бочек?

  2. Если да, то что относительно альфа-спиралей делает их непригодными для этих функций?

Ответы


Nandor Poka

Как вы можете видеть на странице Википедии, вы связали себя тем, что бета-бочки имеют гораздо больший диаметры (в некоторых случаях до 40 ангстрем, как указано в этой статье) в зависимости от количества бета-листов, составляющих ствол, по сравнению с диаметром альфа-спираль (фиксированная) 6 ангстрем. (источник http://www.chem.uwec.edu/Modeling/GGProteinStructures/Pages/alpha_helix/helix.html ). Альфа-спирали хороши для закрепления белков в мембране или образования небольших отверстий, подходящих для таких соединений, как ионы, в то время как с бета-бочками можно транспортировать более крупные соединения, такие как сахара или различные лекарственные средства.

Есть хороший список белков с различными функциями для обоих типов в википедии

Смотри также