Вы пробовали те:

• Черепаха

  Он доступен практически для ВСЕХ платформ,

Turtl позволяет делать заметки, добавлять веб-сайты в закладки и хранить документы для конфиденциальных проектов. От обмена паролями с вашими коллегами до отслеживания исследований статьи, которую вы пишете, Turtl хранит все это в безопасности от всех, кроме вас и тех, с кем вы делитесь.

Он имеет расширения закладок для вашего браузера, которые позволяют легко добавить в закладки текущую страницу, на которой вы находитесь. Это удобно для быстрого сохранения сайтов для последующего чтения или для создания списка часто посещаемых страниц.

- Зим

Вы можете проверить больше скриншотов здесь

- LeaNote

Судя по всему, это с открытым исходным кодом.

- Boostnote

редактировать

- QOwnNotes

QOwnNotes — еще один вариант

редактировать 2

- TiddlyWiki

ссылка Area51

Организационный режим , работающий поверх Emacs, имеет множество функций для ведения, категоризации и организации заметок. В самом Emacs есть общая функция выделения: введите M-x regexp-highlight RET, затем регулярное выражение, которое вы хотите выделить. Например, регулярное выражение cheese.+выделяет слово cheeseи все после него в одной строке.

Возможно , ToDoList может быть еще одним программным обеспечением, на которое стоит взглянуть.

• является бесплатным и открытым исходным кодом,
• хотя его можно рассматривать в первую очередь как программное обеспечение для списка дел, я думаю, что оно очень хорошо подходит для вашего варианта использования,
• вы можете пометить, выделить, упорядочить и классифицировать свои заметки,
• он работает на машинах Linux/Debian, хотя требуется небольшая настройка ,
• и вы можете организовать веб-ссылки и связанный с ними контекст без проблем.

Вот быстрый снимок экрана:

Я думаю, что это действительно классная программа, возможно, стоит посмотреть.