Почему MVA имеет буфер высоты 1000 футов?

SKYBrary, которого вы цитировали, обычно ссылается на ICAO. В этом случае ИКАО не упоминает 1000 футов, а только температурные поправки, которые должны применяться (пилотом*) в PANS OPS.

*

В документах ИКАО мало определено, кто отвечает за пролет над землей и препятствиями. Существующие ссылки противоречивы или не отражают современную среду ОрВД, когда процедуры прямого отслеживания, векторизации и RNP регулярно уводят воздушные суда от опубликованных маршрутов ОВД.

— Международная федерация ассоциаций авиадиспетчеров — 54-я ежегодная конференция — София, 20–24 апреля 2015 г. ( PDF )

Но 1000 футов служит своим целям:

1. Обеспечивает достаточное время реакции, чтобы диспетчер заметил отклонение пилота и принял меры, давая достаточно времени для восстановления, например, неправильно расслышанный или неправильно введенный уровень высоты.
2. Не вызовет предупреждений EGPWS: при движении ниже пола взлетно-посадочной полосы будет звучать сигнал тревоги СЛИШКОМ НИЗКАЯ ПЛОЩАДЬ — предлагаемые 300, 500 и 600 футов находятся либо слишком близко к полу, либо ниже его, в зависимости от того, насколько далеко находится самолет; аналогично для других систем предупреждения о пролете препятствий на легких самолетах
3. Обеспечивает достаточно хороший буфер для случаев, когда температура слишком низкая, если пилот не откорректировал ее.

Пол клиренса взлетно-посадочной полосы EGPWS (RFCF) из руководства по летной эксплуатации Airbus