Книги по популяции или эволюционной генетике?

TL;DR

Я бы порекомендовал «Популяционная генетика: краткое руководство» (Гиллеспи) для введения в популяционную / эволюционную генетику (спасибо AGS за то, что высветил этот мой большой промах в первой версии моего ответа).

Я бы порекомендовал руководство Биолога по математическому моделированию в эволюции и экологии (Отто и Дэй) , если вы хотите подтвердить свои знания в области математики, изучив их применение в эволюционной биологии.

Общие вводные книги по популяционной генетике

Есть несколько книг, которые предлагают введение в популяционную генетику. Я прочитал «Принципы популяционной генетики» (Хартл и Кларк) . Я оценил это, но на вашем месте я бы скорее попробовал «Элементы популяционной генетики» (Чарльсворт) или « Популяционная генетика» (Гамильтон) . Есть еще «Генетика популяций» (Хедрик) . Я склонен думать, что в этой последней книге представлено много эмпирических данных по популяционной генетике, и в ней не так много внимания уделяется теоретическим концепциям, как в других (но я могу ошибаться). Книга Гиллеспи « Популяционная генетика: краткое руководство».является классикой. Он короткий, очень легкий для понимания и приятный для чтения. Книга Гиллеспи, возможно, со временем немного устарела, но я все равно очень рекомендую ее.

Акцент на аналитическом моделировании

Руководство биолога по математическому моделированию в эволюции и экологии (Отто и Дэй) — очень хорошая и очень доступная книга. Это хороший обзор всех предметов, которые обычно преподаются первокурсникам биологии, таких как, например, линейная алгебра. Он очень доступен, и в то же время он заходит довольно далеко, поскольку в конце концов говорит о применении уравнения диффузии в популяционной генетике (работа Кимуры среди прочих). В этой книге представлены некоторые важные модели популяционной генетики, но, поскольку она направлена ​​на предоставление инструментов для математического моделирования в экологии и эволюции, в ней могут быть недостаточно учтены некоторые области экологии и эволюционной биологии. Например, в книге не говорится ни о структуре населения, ни об эволюционной теории игр, и мало что говорится о теории слияния.

Другие книги, посвященные конкретным вопросам популяционной генетики.

Коалесцентная теория: введение (Джон Уэйкли) — хорошая книга. Я не читал его полностью из-за проблем со временем и из-за того, что математика для меня немного сложна. Коалесцентная теория предлагает очень важный набор математических инструментов в эволюционной биологии.

Есть еще математическая популяционная генетика (Юенс) . Я в настоящее время читаю его. Это определенно не вводная книга, и она действительно не охватывает большую часть наиболее распространенных областей популяционной генетики.

Если вас особенно интересует население с возрастной структурой, « Эволюция населения с возрастной структурой» (Чарльсворт) — очень хорошая книга.

Моделирование эволюции (Roff) предлагает некоторое обсуждение того, как математически определить приспособленность по фенотипическим признакам. Пока это интересно, я бы не советовал вам его покупать. Более того, вся математика довольно проста и направлена ​​на то, чтобы объяснить, как выполнять математическое моделирование с помощью R, что, на мой взгляд, не обязательно для изучения, поскольку другие языки лучше справляются с математикой (например, Mathematica).

Evolutionary Conservation Biology (Ferrière, Couvet and Dieckmann) — очень хорошая книга по сохранению и генетике сохранения. Он разрабатывает некоторые математические модели, которые представляют особый интерес для сохранения популяций и сообществ.

Книга « Экология, генетика и эволюция в метапопуляциях» (Хански и Гаджиотти) может вас заинтересовать. Однако в нем гораздо больше внимания уделяется экологии, чем в других, упомянутых выше. Примечание: я не читал его полностью.

Если вы заинтересованы в родственном отборе и уровне отбора, возможно, вы захотите взглянуть на классическую книгу «Основные переходы в эволюции» (Мейнард Смит и Сатмари) (хотя я ее не читал) или «Возвращение к основным переходам в эволюции» ( Калькотт и Стерельный) , которые отражают мнение многих авторов по этому вопросу. Evolutionary Dynamics: Exploring the Equations of Life (Nowak) также представляет интерес, особенно. для тех, кто интересуется эпидемиологией. Наконец, вы, возможно, захотите взглянуть на очень хорошо написанные и легко читаемые книги Докинза, такие как «Расширенный фенотип» (Докинз)Например. Книга Докинза очень популярна и очень вводна. Он предлагает больше способов мышления, чем реальная наука, стоящая за эволюционной биологией.

Список @Remi.b превосходен, но он также должен включать «Популяционная генетика Гиллеспи: краткое руководство» .

Не относительно короткий, но я собираюсь повторить рекомендацию, которую я только что дал в другой теме. Популяционная генетика и микроэволюционная теория Алана Темплтона охватывает многие из тем, перечисленных выше, и требует самостоятельного изучения различных статистических данных о структуре населения с примерами. Это вводный учебник для людей со статистическим образованием (хотя он также включает статистическое приложение). Существует довольно много обсуждений байесовского вывода и других методов моделирования.

Мне лично нравится учебник по популяционной биологии Уилсона и Боссерта. Для книги, которой почти 45 лет, вполне неплохо. Одна из лучших особенностей этой книги заключается в том, что в ней приводятся примеры, а затем шаг за шагом рассматриваются решения. Время от времени он становится слишком математическим для этого биолога, но в целом я нахожу его читабельным и информативным.

Я думаю, что эта книга очень точно соответствует всем вашим критериям.