Органайзер PDF с виртуальной иерархией, быстрым просмотрщиком, выделением, поиском

В прошлом уже было много вопросов по этому поводу, например здесь . Но я чувствую, что многие из них, вероятно, несколько устарели, ведь 2018 год стремительно приближается.

Я только в третьем семестре, но я уже замечаю, что собираюсь собрать тонны PDF-файлов, изрядное количество таких, которые я хотел бы сохранить для дальнейшего чтения. Я ищу инструмент PDF, который дает мне следующие функции:

  • Грамотная систематизация документов. Я хочу иметь папки/подпапки. Если я хочу переместить документы из одной папки в другую, это должно происходить очень быстро и без особых усилий. Структура должна быть независимой от фактической файловой структуры на моем жестком диске.

  • Стабильный встроенный в программу просмотрщик PDF или возможность установить программу по умолчанию для открытия документов. Подсветка. Мне нравится подсвечивать разными цветами, и я хочу выбрать цвет, не просматривая кучу вариантов выбора, чтобы переключить цвет выделения. Для меня разные цвета имеют разное значение, так что это тоже должно пройти быстро. То же самое с нотами. Возможность добавить текстовое поле с ярлыком будет высоко оценена.

  • Скорость. Скачал Менделей. Если Skim может свободно отображать PDF, я ожидаю того же от инструмента организации PDF. Я не хочу ждать загрузки страницы 0,8 с, если я быстро прокручиваю документ. То же самое с масштабированием. Я хочу использовать свой трекпад для масштабирования или нажимать ctrl при использовании мыши. Но необходимость нажимать кнопку +/- масштабирования, безусловно, не вариант.

  • Параметры поиска. На первый взгляд мне очень понравилось, как Mendeley отображает так много информации о PDF-файлах, и я могу только представить, насколько желательно искать документы, например, по авторам.

  • Возможность формировать группы/папки, которыми я могу поделиться с другими.

  • Должен быть доступен на macOS, поддержка Ubuntu будет плюсом.

  • Я заметил, что много вопросов было и по бибтексу. У меня очень мало опыта работы с референсами с использованием Latex, но я думаю, что рано или поздно я достигну точки, когда мне понадобятся эти вещи.

Сколько для вас "много"? 100, 10.000, миллион?
На данный момент у меня их около 200, но скорость накопления новых документов быстро растет. Я имею в виду, что я уже (хочу) сохранить намного больше PDF, чем, например, в начале семестра.
Возможно, вы недооценили портативность . После перехода на новую машину (Mac или любую другую), на новую операционную систему или после перехода на новую версию органайзера 5 лет спустя ваша старая система организации может быть безвозвратно утеряна.
Не относится к академическим кругам?
Всякий раз, когда мой мозг анализирует «организовать», он возвращает «синтаксическую ошибку»!
«Я не хочу ждать загрузки страницы 0,8 с, если я быстро пролистываю документ. То же самое с масштабированием». У меня нет такой проблемы с Mendeley, а это 7-летний ПК...
Я точно не знаю, что такое Mendeley, но, судя по непродолжительному поиску в Google, это проприетарное программное обеспечение, которое стоит 100 долларов США в год, если используется облако. Лучшей альтернативой является Bibtex, о котором ОП упомянул в последнем предложении. Bibtex — это квазистандарт в публикациях, связанных с arxiv, и поддерживается такими инструментами, как Jabref и Zotero. Я лично использую файл Bibtex в конце моего файла Lyx для вставки библиографических ссылок.
@ManuelRodriguez Bibtex не делает ничего из того, о чем просит ОП. Помимо, возможно, возможности поиска.
@FedericoPoloni Я не согласен. В своем ответе я пытаюсь объяснить, как ОП может использовать LaTeX/BibTeX.

Ответы (3)

Одним из инструментов, который, кажется, соответствует вашим требованиям, является Zotero . Я очень рекомендую это. В частности, у меня был хороший опыт работы с ним на разных платформах и веб-браузерах, включая Ubuntu с Chrome и Firefox.

Zotero позволяет организовать вашу коллекцию документов в папки и хранить один и тот же элемент в нескольких папках (коллекции в терминологии Zotero). Вы можете прикрепить файл .pdf статьи к библиографическим данным этой статьи, и Zotero сможет выполнять поиск по содержимому ваших файлов .pdf. Zotero хорошо интегрируется с Bibles и Latex.

Скриншот
Зотеро (источник: Википедия ; щелкните изображение, чтобы увеличить его)

Zotero использует лицензию AGPLv3. Более подробную информацию можно найти, например, в Википедии .

Он также имеет хорошие функции экспорта с помощью плагинов, поэтому он не привязывает вас к определенному программному обеспечению / рабочему процессу. И это ФЛОСС.
Пожалуйста, включите информацию о лицензии, подробности о масштабировании и выделении, а также скриншот, спасибо!
Не могли бы вы также описать, как можно использовать Zotero для управления документами в соответствии с просьбой OP? Он описывается как «программное обеспечение для управления ссылками», в основном работающее с цитатами (хотя можно прикреплять PDF-файлы).

Я использую инструмент под названием TheBrain.

Вы можете скачать пробную версию. Это не бесплатно, но если ваша профессиональная или академическая жизнь зависит от инструментов, вам понадобится самая подходящая помощь.

Вы можете просмотреть учебник в учебниках и, в частности, вы можете просмотреть веб-семинар в разделе Использование TheBrain для визуального управления файлами.

Обычно они демонстрируют его на компьютерах с Windows, но я использую его на macOS (Mac Mini, High Sierra).

См. также эту таблицу сравнений , в которой показаны характеристики таких программ, как Zotero (но не TheBrain).

С наилучшими пожеланиями ... ура, дрл

Напишите обзор литературы в LaTeX, используя BibTeX для управления ссылками.

Убедитесь, что каждая запись BibTeX содержит достаточно информации для доступа к соответствующей рукописи. Обычно я не включаю никакой информации: я могу искать в Google Scholar по названию, и это дает мне доступ к рукописи. Иногда к рукописи невероятно сложно получить доступ, в таких случаях я включаю URL-адрес в свою запись BibTeX. Оглядываясь назад, я должен был включить DOI каждой рукописи, если таковая имеется.

Я считаю, что этот метод достигает ваших целей, а обзор литературы предоставляет богатый источник информации. Более того, обзор, скорее всего, когда-нибудь будет опубликован.

Организация против просмотра . Этот ответ касается только организационного аспекта вопроса. Тем не менее, принятие этого ответа, вероятно, изменит потребности просмотра. (Например, примечания будут отображаться в обзоре литературы, а не в виде аннотаций в научных статьях.) Аспект просмотра просто требует выбора правильного средства просмотра PDF. Варианты для Linux включают Foxit Linux PDF Reader, GNU GV, Mupdf, Okular, Qpdfview и XPDF.