Использует ли ДНК-полимераза I бактерий прямую или обратную экзонуклеазную активность для удаления РНК-праймеров? В одной из моих книг говорится, что она использует экзонуклеазную активность от 5' до 3', а в другой говорится, что она использует экзонуклеазную активность от 3' до 5'.
Обновление: я знаю, что РНКаза H может удалить праймеры, но экзонуклеазная активность pol I также может их удалить.
Из википедии :
В процессе репликации РНКаза H удаляет РНК-праймер (созданный Primase) с отстающей цепи, а затем Полимераза I заполняет необходимые нуклеотиды между фрагментами Окадзаки (см. Репликация ДНК) в направлении 5' -> 3'...
И в другом месте той же статьи:
Pol I обладает четырьмя ферментативными активностями:
- 5 '-> 3' (прямая) ДНК-зависимая ДНК-полимеразная активность, требующая 3'-сайта праймера и матричной цепи.
- 3 '-> 5' (обратная) экзонуклеазная активность, которая обеспечивает корректуру.
- Экзонуклеазная активность 5 '-> 3' (прямая), опосредующая трансляцию никеля во время репарации ДНК.
- 5' -> 3' (прямая) РНК-зависимая ДНК-полимеразная активность. Pol I действует на матрицах РНК со значительно меньшей эффективностью (0,1–0,4%), чем на матрицах ДНК, и эта активность, вероятно, имеет лишь ограниченное биологическое значение.
Так что ответ на ваш вопрос - ни то, ни другое. РНКаза H удаляет праймеры, а экзонуклеазная активность ДНК Pol I не имеет отношения к удалению праймеров, хотя оказывается, что она может действовать в любом направлении в зависимости от контекста.
Поиск в Google вашего вопроса показал, что именно РНКаза H удаляет праймер РНК. ДНК Pol I обладает как 3'-5', так и 5'-3' экзонуклеазной активностью для корректуры и восстановления порезов соответственно. См. вики на Pol I