Когда образуется вода во время фотосинтеза?

Формула фотосинтеза:

6 С О 2 + 12 ЧАС 2 О С 6 ЧАС 12 О 6 + 6 О 2 + 6 ЧАС 2 О

Я могу сосчитать углероды, воду на стороне реагента, кислород и глюкозу, но я не могу определить, где при светлой или темной реакции снова образовалось 6 молекул воды. Где и когда они были произведены?

почему ты не можешь просто уменьшить 6 ЧАС 2 О с обеих сторон? У вас есть источник этого уравнения?
@aandreev Поиск в Google формулы фотосинтеза «12h2o» дает несколько источников, цитирующих версию «12h2o». Хотя это может быть и неправильно, но, по крайней мере, широко распространено.
о, я люблю, когда биологи занимаются физикой/математикой
@aandreev Вы не можете думать об этой реакции как о математической формуле, вода справа на самом деле образуется в результате реакции, она не остается. В то время как зеленые растения используют ЧАС 2 О , некоторые бактерии используют ЧАС 2 С вместо этого они также производят воду справа. Кроме того, это показывает чистую реакцию, которая имеет много-много промежуточных стадий. Основная реакция – С О 2 + 2 ЧАС 2 О ( С ЧАС 2 О ) + О 2 + ЧАС 2 О . Однако для производства глюкозы ( С 6 ЧАС 12 О 6 ), вам нужно 12 молекул воды и 6 углекислого газа. Я люблю, когда физики пытаются заниматься биологией.
Я понимаю, что несколько шагов складываются в одно уравнение. И это то, что должен содержать ответ, химическое уравнение, где вода появляется как продукт, или те, где вода берется из окружающей среды.

Ответы (2)

Некоторая часть расщепленной воды регенерируется, когда гидроксильные радикалы (активные формы кислорода) превращаются в перекись водорода, воду и т. д. с помощью супероксиддисмутаз и антиоксидантных механизмов в хлоропластах (об этом позаботятся пероксисомы/каталазы и т. д.). Есть также некоторые доказательства того, что присутствие маннита, аскорбата и глутатиона также защищает от АФК, образующихся в хлоропластах. Таким образом, вы вводите воду, и, пытаясь избежать окислительного повреждения, вы получаете некоторое количество воды. Однако сбалансированное уравнение этого не отражает, потому что это не реальный продукт фотосинтеза.

О АФК и защитных элементах

Дополнительное чтение по АФК в фотосинтетических системах

Я думаю, что это очень неясный факт, и, несмотря на реальность вещей, на самом деле трудно запросить литературу. Хороший вопрос.

Значит, образующаяся вода на самом деле не является частью фотосинтеза? Тогда не было бы фактическое уравнение фотосинтеза 6 С О 2 + 12 ЧАС 2 О С 6 ЧАС 12 О 6 + 6 О 2 ? (Не сбалансировано, но отражает реальность, не так ли?)
Кроме того, при гидролизе 18 АТФ должны ли 18 молекул воды также включаться в уравнение со стороны реагентов?
Итак, вы гидролизовали 18 АТФ, и если вы посмотрите на цикл Кальвина, то на каждый CO2, входящий в цикл, вы расходуете 2 АТФ на образование G3P и 1 АТФ на регенерацию рубиско. Итак, 18/3 = 6, и это совпало бы с вхождением 6 CO2 в цикл или нормальное уравнение фотосинтеза. Кто-нибудь, поправьте меня, если я ошибаюсь! Что касается условности, мы бы сказали, что да, 12 молекул воды пошли на образование сахара и кислорода в действительности, но если бы мы не отметили регенерацию воды где-то в формуле, нам пришлось бы предположить накопление активных форм кислорода!

Короткий ответ

Короткий ответ: шесть молекул воды в левой части происходят из CO 2 , побочного продукта восстановления . То есть углекислый газ можно (формально) рассматривать как источник атомов кислорода в шести молекулах воды RHS (с протонами, поступающими из «окружающей среды») 1† .

При фотосинтезе только половина атомов кислорода СО 2 теряется на восстановление .

Сбалансированное уравнение, данное OP (уравнение 1 ниже), признает это и предполагает, что другая половина остается частью синтезированной гексозы.

При фотосинтезе восстановление углекислого газа происходит не полностью. Если мы полностью восстановим CO 2 до метана (8-электронное восстановление) , оба атома кислорода будут потеряны и (в простейшем случае) превратятся в воду.

Включив 12 молекул воды в левую часть, сбалансированное уравнение также признает, что 12 восстановительных эквивалентов (24 электрона), необходимых для образования глюкозы из 6 CO 2 , происходят из воды и дают начало 6 молекулам дикислорода (то есть кислороду). является «расщепленным»).

Короче говоря, шесть вод справа являются результатом восстановления двуокиси углерода, тогда как двенадцать вод слева обеспечивают необходимые 12 восстановительных эквивалентов .

Здесь нужно добавить, что уравнение (1) применимо к фотосинтезу зеленых растений и цианобактерий: не все фотосинтезирующие организмы используют воду в качестве донора электронов или производят O 2 в качестве побочного продукта.

Уравнения фотосинтеза

Уравнение, данное OP (уравнение 1), представляет собой общее сбалансированное уравнение для фотосинтеза зеленых растений и цианобактерий (см. , например , Abeles, Frey & Jencks , 1992, стр. 635) 2† :

(1) 6 С О Икс 2 + 12 ЧАС Икс 2 О С Икс 6 ЧАС Икс 12 О Икс 6 + 6 О Икс 2 + 6 ЧАС Икс 2 О  

Мы можем резюмировать следующим образом:

  • 12 восстановительных эквивалентов (24 электрона) необходимы для восстановления 6 углекислых газов до 1 глюкозы. Они поставляются водой .

  • Вода является источником кислорода, выделяемого при фотосинтезе зеленых растений (не CO 2 ) .

  • При восстановлении СО 2 «образуются» шесть углерод-углеродных и шесть углерод-водородных связей (что соответствует потребности в 12 восстанавливающих эквивалентах).

  • При восстановлении 6 CO 2 в качестве побочного продукта образуется шесть молекул воды.

  • Для восстановления 1 CO 2 требуется 2 восстановительных эквивалента (четыре электрона). Или для восстановления 1 CO 2 требуется 2 молекулы воды.

  • CO 2 является «фиксированным»

Кроме того, мы можем добавить следующее:

  • Реакция термодинамически неблагоприятна, поскольку необходимая свободная энергия (около 600 ккал/моль) обеспечивается солнечным светом ( Abeles, Frey & Jencks , 1992).

Но зеленые растения и цианобактерии — не единственные фотосинтезирующие организмы, и не все фотосинтезирующие организмы используют воду в качестве источника электронов (или выделяют кислород).

Некоторые фотосинтезирующие бактерии используют сероводород (H 2 S) и «вырабатывают» элементарную серу, а не кислород. Сбалансированное уравнение может быть записано следующим образом:

(2) 6 С О Икс 2 + 12 ЧАС Икс 2 С С Икс 6 ЧАС Икс 12 О Икс 6 + 12 С + 6 ЧАС Икс 2 О  

Можно видеть, что, хотя в правой части уравнения вода не появляется, вода все равно образуется в результате восстановления CO 2 .

Теперь можно дать сбалансированное уравнение, описывающее фотосинтез в целом, где H 2 A — любое вещество, которое может быть окислено до A ( Abeles, Frey & Jencks , 1992):

(3) 6 С О Икс 2 + 12 ЧАС Икс 2 А С Икс 6 ЧАС Икс 12 О Икс 6 + 12 А + 6 ЧАС Икс 2 О  

Другими примерами H 2 A являются H 2 , изопропанол и лактат.

Восстановление одного углекислого газа

Заметим прежде всего, что окисление двух молекул воды до одного O 2 является четырехэлектронным (два восстановительных эквивалента) окислением.

(4) ЧАС Икс 2 О + ЧАС Икс 2 О О Икс 2 + 4 е Икс + 4 ЧАС Икс +  

Фотосинтетическое восстановление одного диоксида углерода можно представить следующим образом ( Abeles, Frey & Jencks , 1992), и мы можем отметить, что это четырехэлектронное восстановление:

(5) С О Икс 2 + 2 ЧАС Икс 2 О Икс * час в ( С ЧАС Икс 2 О ) + О Икс 2 Икс * + ЧАС Икс 2 О  

Звездочка указывает, что если метить атом кислорода в воде (например, изотопом кислорода), то метка находится в кислороде 3† .

В фотосинтезе зеленых растений (неполное) восстановление 1CO 2 требует двух восстанавливающих эквивалентов, которые поставляются 2 H 2 O, и этот четырехэлектрон приводит к образованию 1 O 2 и 1 H 2 O.

Окисление и восстановление

Я подозреваю, что большинство читателей этого поста знают все, что следует из этого раздела. Тем не менее, то, что является окислением/восстановлением, а что нет, кажется, иногда вызывает путаницу, и некоторые примеры могут помочь прояснить ситуацию.

Окисление – это потеря электронов . Редукция - это присоединение электронов . Гидратация не является ни окислением, ни восстановлением, ни ионизацией.

Некоторые примеры

Реакция, показанная в уравнении (6), представляет собой окисление (этан окисляется до этанола). ( Электроотрицательный кислород «забрал» пару электронов у второго атома углерода, который окисляется)

(6) С ЧАС Икс 3 С ЧАС Икс 3 + 1 2   О Икс 2 С ЧАС Икс 3 С ЧАС Икс 2 О ЧАС  

Реакция, представленная в уравнении (7), не является ни окислением, ни восстановлением, а представляет собой дегидратацию (дегидратацию этанола до этилена). Атом кислорода не окисляется и не восстанавливается. Он «владеет» таким же количеством электронов в этаноле, как и в воде. (Хорошим примером реакции гидратации/дегидратации из мира биохимии является фумараза . Образование малата из фумарата ни в каком смысле не является оксидоредукцией ). Это важно.

(7) С ЧАС Икс 3 С ЧАС Икс 2 О ЧАС С ЧАС Икс 2 знак равно С ЧАС Икс 2 + ЧАС Икс 2 О  

Реакция в уравнении (8) представляет собой восстановление (восстановление карбоксилатной группы уксусной кислоты до альдегида (ацетальдегида)), но обратите внимание, что кислород в воде не изменил свою степень окисления. Когда вода удаляется, она уходит, «забирая с собой, с точки зрения электронов, то, что уже принадлежит». Но, в отличие от предыдущего примера, четырехвалентность углерода «поддерживается» за счет «приобретения» пары электронов (восстановление).

Примером из мира биохимии является альдегиддегидрогеназная реакция, где НАД + действует как акцептор электронов.

(8) С ЧАС Икс 3 С О О ЧАС + 2 ЧАС Икс + + 2 е Икс С ЧАС Икс 3 С ЧАС О + ЧАС Икс 2 О  

Уравнение (9) также является восстановлением (восстановлением ацетальдегида до этанола). Примером может служить алкогольдегидрогеназная реакция.

(9) С ЧАС Икс 3 С ЧАС О + 2 ЧАС Икс + + 2 е Икс С ЧАС Икс 3 С ЧАС Икс 2 О ЧАС  

Этот последний пример (уравнение 10) представляет собой ионизацию (ионизацию уксусной кислоты) и ни при каких обстоятельствах не может считаться ни окислением, ни восстановлением (все электроны «остаются на месте»).

(10) С ЧАС Икс 3 С О О ЧАС С ЧАС Икс 3 С О О Икс + ЧАС Икс +  

(Когда речь идет об окислении и восстановлении, протоны «свободны». Мы можем добавлять или удалять их, не изменяя степень окисления).

Рант

Отсутствие различия между гидратацией/дегидратацией и окислением/восстановлением привело к утверждениям, что вода в цикле Кребса является источником восстановительных эквивалентов. Рэкер, например, утверждает в «Новом взгляде на механизмы в биоэнергетике », что электроны из воды переносятся по дыхательной окислительно-восстановительной цепи, а Визер утверждает, что вода обеспечивает «дополнительные восстановительные эквиваленты, необходимые для преобразования химической энергии одной молекулы глюкозы в эту энергию». из 36 молекул АТФ'. Оба этих утверждения, ИМО, ерунда (см. здесь ).

Окончательный взгляд на сокращение выбросов CO 2

Давайте еще раз взглянем на восстановление СО 2 (где углерод «полностью окисляется») и уменьшим его, добавляя восстанавливающие эквиваленты (пары электронов) по одному, пока углерод полностью не восстановится, то есть до тех пор, пока мы достичь СН 4 . (Нам также нужно будет добавлять пару протонов на каждом этапе, но что касается окисления и восстановления, как сказано выше, они «бесплатны»).

Добавление пары электронов к CO 2 дает муравьиную кислоту, добавление следующей пары дает формальдегид плюс молекулу воды , добавление еще одной пары дает метанол, а добавление последней пары дает метан плюс еще одну молекулу воды.

Это суммировано в уравнении (11).

(11) С О Икс 2 2 ЧАС Икс + , 2 е Икс HCOOH 2 ЧАС Икс + , 2 е Икс НСНО + ЧАС Икс 2 О 2 ЧАС Икс + , 2 е Икс С ЧАС Икс 3 О ЧАС 2 ЧАС Икс + , 2 е Икс С ЧАС Икс 4 + ЧАС Икс 2 О

Атомы кислорода в молекулах воды, удаленных на стадиях 2 и 4, не изменили своей степени окисления.

Для полного восстановления диоксида углерода до метана требуется 8 электронов, а два атома кислорода удаляются в виде воды. Для восстановления шести углекислого газа до одной глюкозы требуется 12 восстановительных эквивалентов (24 электрона). Если бы природа решила сделать гексан ( С ЧАС Икс 3 С ЧАС Икс 2 С ЧАС Икс 2 С ЧАС Икс 2 С ЧАС Икс 2 С ЧАС Икс 3 ) продукт хранения фотосинтеза, для этого потребовалось бы 19 восстановительных эквивалентов (38 электронов), а если бы метан был конечным продуктом фотосинтеза, то потребовалось бы 4 восстановительных эквивалента (восемь электронов) на каждый окисленный СО 2 .

Сноски

  1. В «реальном мире» фотосинтеза зеленых растений кислород «теряется» в виде фосфата, а не воды, в реакции глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (см. здесь ), ключевом этапе фотосинтеза, когда восстанавливающие эквиваленты входят в углеродный скелет. (см. здесь ). Электроотрицательный атом (кислород), «отщепленный» для «приспособления» к поступающим восстанавливающим эквивалентам, не обязательно должен быть частью молекулы воды (или, в более общем смысле, вообще должен быть кислородом).

  2. В случае аэробного дыхания общее уравнение можно представить следующим образом, в котором подчеркивается, что 6 атомов О 2 дают образование 12 Н 2 О (шесть 4-электронных восстановлений) и что (формально) 6 вод расходуются на производство 6 СО 2 . Вычитание 6 вод с обеих сторон, как это иногда делается (см. здесь ), приводит только (по крайней мере, ИМО) к путанице.

(12) С Икс 6 ЧАС Икс 12 О Икс 6 + 6 О Икс 2 + 6 ЧАС Икс 2 О 6 С О Икс 2 + 12 ЧАС Икс 2 О  

  1. Этот эксперимент был проведен Каменом и Рубеном (1943) с использованием 18 О в качестве индикатора. Мартину Камину и Сэму Рубену приписывают совместное открытие 14 C, этого великого дара биохимии и науке в целом. Сэм Рубен умер от отравления фосгеном , который он готовил для военных действий во время Второй мировой войны. История его смерти остроумно рассказана Мартином Кейменом в Radiant Science .

использованная литература

Абелес , Р. Х. Фрей , П.А., Дженкс , В.П. (1992) Биохимия , Джонс и Бартлетт

Камин , доктор медицины (1985) Radiant Science, Dark Politics. Воспоминания о ядерном веке. Калифорнийский университет Press. Google Книги