на что указывает перекрытие последовательностей

что это значит, если разные белковые последовательности перекрываются при множественном выравнивании, одинаковы ли они, имеют ли они общего предка, являются ли они рекомбинантами друг друга, и как можно доказать это, большое спасибо

Сначала это означает только то, что эти последовательности имеют сходство (извините, но не более того). Это может означать, что они являются более мелкими частями более крупного белка, который был расщеплен, это может означать, что вы выровняли разные белки, которые лишь частично похожи, и так далее. Чтобы перейти к этому, вы должны предоставить дополнительную информацию. И/или покажите изображение выравнивания, если это возможно.
Просто любопытно, @user5182 вы в настоящее время получаете степень магистра биоинформатики в ICL?
@chris да, я думаю, что одна из последовательностей является «настоящей последовательностью», а остальные 3 представляют собой перестроенные фрагменты, я работаю с токсинами специально, если это поможет, я пытался опубликовать последовательность ранее, но, к сожалению, поскольку это не было в кадр люди жаловались на то, как это было неясно. пожалуйста, дайте мне знать, если есть что-то конкретное, что я должен искать. большое спасибо
@hello_there_andy нет, я получаю степень магистра в области фармации, моя диссертация посвящена диверсификации токсинов на коралловом рифе.

Ответы (2)

Расширение комментария @Chris:

Короткий ответ

Перекрывающиеся последовательности подразумевают эволюционно консервативные области , т.е. сохраняющиеся в процессе эволюции во времени благодаря тому, что они выполняют какую-то важную функцию.

Длинный ответ

Предполагая, что последовательности гомологичны , перекрывающиеся области сходства показывают «эволюционно консервативные области».

Это участки белковой последовательности, общие для предков на протяжении всей истории предков, поскольку эта общая последовательность несет важную функцию на фенотипическом уровне. Эволюция действует, чтобы «сохранить» последовательность посредством естественного отбора, если эта функция была важна для приспособленности (см. Отрицательный отбор ).

Например, возможно, общая последовательность кодирует активный сайт для фермента, который является общим для всех предков, которых вы используете при множественном выравнивании последовательностей, тогда естественный отбор предотвратит появление изменений в этой последовательности.

Подробности смотрите в этой онлайн-лекции .

еще одна небольшая информация: у белков всегда есть короткие, но хорошие перекрытия, что в большинстве случаев указывает на сходство доменов.

это означает, что эти области сохраняются, если вы сравниваете две последовательности и обнаруживаете сходство. Одним из примеров является область кодирования Hox, которая сохраняется и показывает сходство.

Продолжайте добавлять информацию о том, как это доказать.
на что указывает перекрытие последовательностей
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 2v