Почему гексозомонофосфатный шунт (пентозофосфатный путь) называется прямым окислительным путем (см. биохимию Сатьянараяны, 4-е издание, стр. №: 244), хотя молекула кислорода не используется для окисления? Он использует НАДФ для своего окисления. Итак, если использование НАДФ представляет собой прямое окисление, то что же тогда будет непрямым окислением? Как отличить прямое и непрямое окисление? Считается ли использование электрон-транспортной цепи вторичным окислением?
Этот ответ основан на автобиографическом отчете 2002 года о работе Бернарда Л. Хорекера под названием «Путь пентозофосфата» . Здесь он ссылается на «прямой окислительный путь», но не объясняет его однозначно, поэтому я резюмирую свою интерпретацию, а затем привожу доказательства в виде цитат.
Краткое изложение моей интерпретации рассказа Хорекера
Когда в конце 1930-х и 1940-х годах выяснялось то, что я первоначально назвал гексозомонофосфатным шунтом (ГМС), считалось, что его основная цель та же, что и для аэробного гликолиза — окислять глюкозу для получения энергии — и был просто альтернативным способом сделать это. Термин «прямой окислительный путь» использовался, чтобы отличить его от гликолитического пути (тогда называемого путем Эмбдена-Мейергофа-Парнаса), предположительно потому, что шесть циклов окислительной фазы е могли полностью окислить одну молекулу глюкозо-6-фосфата до углекислый газ, тогда как гликолиз только окисляет его до пирувата. Предположительно, это рассматривалось как «непрямое окисление», поскольку полное окисление требовало дальнейшего метаболизма пирувата с использованием цикла трикарбоновых кислот.
Термин «прямой окислительный путь» вышел из употребления, так как стало понятно, что основные функции этого пути заключаются в обеспечении пентоз для синтеза нуклеиновых кислот и НАДФН для синтеза жирных кислот, стероидов и восстановления окисленного глутатиона. Именно по этой причине наиболее часто используемое название пути изменилось на пентозофосфатный путь, с переносом акцента на один из продуктов.
Цитаты из Хорекера
…Хаас прибыл из лаборатории Варбурга в 1939 году. Хаас попросил меня присоединиться к нему в поисках фермента, который катализирует восстановление цитохрома с восстановленным ТФН (теперь НАДФ). Эта реакция считалась недостающим звеном в цепи переноса электронов от субстрата к кислороду и положила начало моему интересу к тому, что тогда считалось прямым окислительным путем метаболизма углеводов, но теперь известно как пентозофосфат. путь …
…Эти наблюдения породили гипотезу о том, что окислительный путь на самом деле представляет собой циклический механизм прямого окисления углеводов. С каждым оборотом цикла будет производиться одна молекула углекислого газа, а образовавшиеся пентозофосфаты будут метаболизироваться обратно в гексозофосфаты, чтобы начать новый цикл. Шесть оборотов цикла приведут к полному окислению одной молекулы глюкозы…
… Однако функция (функции) нового пути оказалась совершенно отличной от пути прямого окисления углеводов, которого мы ожидали. Он обеспечивает два механизма производства рибозо-5-фосфата. Одним из них является «окислительная ветвь» пути, которая также генерирует 2 экв. TPNH (NADPH). Рибозо-5-фосфат также может образовываться непосредственно из гексозо- и триозофосфатов в результате неокислительных перегруппировок, катализируемых транскетолазой и трансальдолазой. Там, где требуются большие количества НАДФН, например, при синтезе жирных кислот или стеролов, избыток образующихся пентозофосфатов будет рециклироваться обратно в гексозомонофосфаты.
[Мой акцент]
Google Книги ngrams использования термина
Добавление или удаление Н означает окисление. В этом процессе Н удаляется из сахара, добавляется к НАДФ, а С окисляется до . Следовательно, это реакция окисления.
Путь HMP используется для производства NADPH. Процесс непосредственно окисляет глюкозу до а также . Он не требует цикла TCA или ETC. Отсюда и название прямого окислительного пути.
Гликолиз, с другой стороны, не производит никаких а также . Следовательно, является непрямым, так как для полного окисления требуются ТХУ и ЭТЦ.
Источник: Биохимия У. Сатьянараян. Издание: 2013 г. Стр.: 244 и 245 (написано в скобках на стр. 245).
Дэйвид
JM97
Дэйвид
Дэйвид