Я изучаю аэробный распад глюкозы и кажется, что на каждую молекулу глюкозы мы должны получить молекулы. Однако известно, что мы получаем только 6.
(я не буду останавливаться на всех продуктах и реагентах, а только на важных для образования молекул воды)
Во-первых, при гликолизе на каждую молекулу глюкозы мы получаем две молекулы воды, и 2 молекулы пирувата. При окислении двух молекул пирувата получаем и 2 молекулы ацетил-Ко-А. Итак, мы дважды проходим цикл Кребса, получая а также , и требуется 4 молекулы воды.
Итак, когда мы подходим к электрон-транспортной цепи, у нас отрицательный баланс в 2 молекулы воды, и мы имеем а также . Нам сказали, что от каждой из этих молекул 2 электрона идут в электрон-транспортную цепь, это означает, что всего в систему идет 24 электрона. Проблема возникает здесь:
Итак, учитывая, что у нас есть , должно образоваться 12 молекул воды, так что в конце мы получили 10 молекул воды, но мы знаем, что количество образовавшихся молекул воды должно быть 6. Итак, в моем объяснении явно что-то не так. Я был бы очень рад, если бы вы могли сказать мне, что не так.
Ваша путаница полностью исходит из этого уравнения:
Эта реакция представляет собой сжигание глюкозы. Не так глюкоза окисляется в клетках! Почему так много учебников и курсов по биологии представляют это уравнение при вводе метаболизма, мне непонятно.
Действительно, ваше отслеживание молекул воды верно: начиная с одной молекулы глюкозы, 2 воды образуются при гликолизе, 4 расходуются в цикле трикарбоновых кислот и 12 образуются при окислении НАДН/QH 2 ( т.е. ФАДН 2 ). Таким образом, всего произведено 10 штук.
Чем это отличается от сжигания глюкозы? Ответ заключается в кислороде, введенном неорганическим фосфатом во время фосфорилирования на уровне субстрата . Рассмотрим сбалансированную чистую реакцию биологического окисления глюкозы (упрощенную за счет игнорирования АТФ, образующегося в результате окислительного фосфорилирования, и замены GDP/GTP АДФ/АТФ ):
В частности, рассмотрим образование АТФ из АДФ и P i (HPO 4 2- ). В обеих реакциях фосфорилирования на уровне субстрата (катализируемых GADPH / PGK в гликолизе и сукцинат-КоА-лигазе в цикле трикарбоновых кислот) неорганический фосфат нуклеофильно атакует активированный карбонил (тиоэфир) субстрата и затем переносится на АДФ (с образованием АТФ). :
Кислород исходного неорганического фосфата окрашен в красный цвет. Ключевым моментом является то, что атом кислорода из HPO 4 2- переносится на подложку. Позже этот кислород удаляется в виде диоксида углерода посредством окислительного декарбоксилирования во время превращения пирувата в ацетил-КоА и в цикле трикарбоновых кислот. Это происходит четыре раза для каждой молекулы глюкозы, вступающей в гликолиз, и сопровождается восстановлением НАД + до НАДН. Учитывая, что НАДН используется для восстановления молекулярного кислорода в цепи переноса электронов:
... это объясняет, откуда берутся четыре, по-видимому, лишние молекулы воды при сравнении горения глюкозы с ее биологическим окислением.
Я думаю, вы неправильно понимаете намерение, предполагаемое в утверждении «6 H2O, полученное в результате гликолиза». Число 6 просто связано с количеством атомов углерода, окисляющихся до СО2 в ТСА..., которые генерируют электрон при каждом окислительном происшествии, в котором 6 электронов затем перемещаются в OXPHOS, требуя 3 О2 для образования 6 Н2О. ... Вкратце: всякий раз, когда они говорят, что 6 H2O производятся «аэробно», они конкретно ссылаются на упрощенный компонент OXPHOS (или просто: C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O).
Отметить:
Стехиометрия относительно бесполезна в реальных исследованиях. Не переусердствуйте. Метаболизм невероятно динамичен.
В реальной жизни участие H2O в полном окислении глюкозы намного сложнее: два оборота цикла трикарбоновых кислот генерируют: 4 CO2 из 2 ацетил-КоА, что требует всего 4+ H2O, но имеет только чистую потерю H2O, равную 4. Цитратсинтаза и фумераза потребляют 2 H2O на штуку, чтобы обеспечить производство 4 CO2. Оставшаяся Н2О используется в аконитазе, но в этой реакции не происходит ни потери, ни увеличения Н2О. Пируватдегидрогеназа производит 2 других СО2, образуя в сумме 6 СО2, но на этом этапе не требует H2O. ... Активность OXPHOS: (после 2 циклов TCA) приводит к 48 общим H2O, произведенным между АТФ-синтазой, цитохромоксидазой и енолазой - и, поскольку 4H2O потребляются в TCA, чистое производство H2O на глюкозу фактически составляет 44 H2O.
На каждом витке цикла трикарбоновых кислот поступают две воды: одна на цитратсинтазу, а другая на фумаразу. Кроме того, я не думаю, что правильно говорить, что вы получаете чистую воду в результате гликолиза (на самом деле, если вы посмотрите на то, что вы написали, кислород не уравновешивается). Я думаю, что вам не хватает того, что вы также получаете АТФ, а вода, которую вы получаете на этапе 2PG-> PEP, действительно является частью чистой реакции ADP + phosphate -> ATP + water
.
Чтобы действительно сбалансировать воду, вы должны учитывать все субстраты и побочные продукты окисления глюкозы, включая АТФ/ГТФ.
Роланд
канадец
Арун Бхардвадж
Роланд
Роланд
Арун Бхардвадж
Арун Бхардвадж
Роланд
Арун Бхардвадж