Путаница в построении ментальной карты крысы

Я читаю статью «Топологическая парадигма формирования пространственной карты гиппокампа с использованием постоянной гомологии» Ю. Дабагяна, Ф. Мемоли, Л. Франка, Г. Карлссона.

Я пытаюсь понять следующий график:

введите описание изображения здесь

В части а) графика мы видим кучу цветных точек. Эти точки находятся в гиппокампе крысы, в отличие от идеи, что эти точки находятся в плоскости, по которой движется крыса, и, таким образом, каждая точка представляет собой клетку места гиппокампа, которая в какой-то момент активировалась в каком-то месте тела. плоскость, по которой движется крыса. Обычно на этой картинке огромное количество точек, но мы решили поставить только тех, кто стрелял, те, кто не стрелял, удалены с картинки части а). Кроме того, каждая точка (что означает каждую ячейку места) имеет один цвет, а две ячейки места, имеющие одинаковый цвет, означают, что две ячейки места считаются идентичными и будут рассматриваться как одна ячейка места в части b) рисунка.

В части b) мы записываем время срабатывания каждой точки, при этом каждая точка представлена ​​полосой на оси времени, и все полосы идентичны (одинаковой высоты и одинаковой толщины).

В части с) изображение находится в плоскости, по которой движется крыса, в отличие от идеи, что изображение части в) находится в гиппокампе крысы. В части c) мы пытаемся получить поля мест из части b). Получение полей места здесь означает, что мы получаем путь, по которому прошла крыса. В частности, поля места находятся в плоскости, по которой движется крыса, а не в гиппокампе, и каждое поле места в плоскости определяется путем наблюдения за тем, какие клетки места в гиппокампе активировали эту область плоскости.

Правильно ли я понимаю? Я не специалист, но мне нужно разбираться в каждой детали этого графика, потому что от этого зависит моя работа. Мое замешательство происходит от того, что здесь есть две области: гиппокамп крысы и плоскость, по которой движется крыса, и мне нужно быть уверенным, в какой области находится изображение.

Ответы (1)

У вас есть пара небольших недоразумений, которые, я думаю, затрудняют понимание рисунка. Здесь нет карты гиппокампа!

1) Примечание: это схематический рисунок. Это не настоящие данные, хотя есть реальные данные, которые показывают эту закономерность. Это должна быть простая для понимания диаграмма, которая объясняет, как работают ячейки места.

2) Панель (а) ВНЕШНЕЕ ПРОСТРАНСТВО. По сути, это вид пола «сверху вниз», по которому бегает крыса.

3) На панели (b) показаны последовательности спайков для трех разных ячеек: эти ячейки были произвольно закодированы цветом. Хэш показывает время, когда клетки 1, 2 или 3 запускали выбросы. На этом рисунке показаны только три ячейки: нет никаких комбинаций ячеек, считающихся одним цветом, или нескольких ячеек одного цвета, только три ячейки и три цвета.

4) Панель (а) показывает, как исследователи связали данные о всплесках, как и в (б), с местонахождением животного. Процедура такова:

  • Начните с пустой карты космоса.
  • Запись из ячейки 1. Каждый раз, когда срабатывает ячейка 1, отмечайте синюю точку на панели (а), указывающую, где находилось животное, когда срабатывала ячейка 1 .
  • Запись из ячейки 2. Каждый раз, когда срабатывает ячейка 2, отмечайте зеленую точку на панели (а).
  • Запись из ячейки 3. Каждый раз, когда срабатывает ячейка 3, отмечайте красную точку на панели (а).
  • (предыдущие шаги могут быть выполнены для более чем 3 ячеек одновременно или последовательно; в этом примере они просто используют 3 ячейки)

5) Панель (с) находится в мировом пространстве, как и панель (а), и она показывает предполагаемый способ, которым животное могло бы использовать активность клеток 1, 2 и 3, чтобы определить, где оно находится в пространстве. Исследователь, делающий запись из клеток 1, 2 и 3, может также использовать эти записи, чтобы предположить, где находится животное. Если только ячейка 3 срабатывает в течение некоторого промежутка времени (соответствующее окно обозначено обведенными овалами на (b)), а ячейки 1 и 2 не срабатывают, то лучше всего предположить, что животное находится в верхней левой заштрихованной области. только красный. Если срабатывают все три клетки, то, скорее всего, животное находится в самом центре перекрывающейся области пространства.

Пунктирная линия показывает гипотетический путь, по которому животное может пройти через окружающую среду. Если бы животное пошло по этому пути, мы ожидали бы увидеть, как активируются клетки места, как на панели (b): сначала только синяя клетка, затем синяя + зеленая, затем все три, затем красная + зеленая и, наконец, только красная. .

6) Очень важно: у животного намного больше клеток, кодирующих место, чем только эти три. Было бы очень запутанно отображать их все в таких различимых цветах, как эти, но именно эта более сложная карта с тысячами измерений дает животному хорошее внутреннее представление о его текущем местоположении.

Надеюсь это поможет!

Большое спасибо, единственное, что осталось неясным, это панель а). В самом деле, совместная стрельба соответствует двум или трем ячейкам для стрельбы в одном и том же месте на полу, и когда это произойдет, мы увидим три точки с тремя разными цветами одна над другой, как если бы они составляли одну и ту же точку, но мы не увидеть любое появление этого на панели а), может быть, они сделали это нарочно для простоты изображения, так как точка с тремя разными цветами не была бы представлена ​​на рисунке, или они предполагали, что на этом рисунке нет копиринга упростить рисование?
также почему на панели б) авторы заменили точки на полосы, это имеет смысл или просто выбор визуализации?
Всплески — это точечные процессы во времени, тогда как пространство непрерывно. а) представляет собой шипы в пространстве; б) представляет собой всплески во времени. В (а) нет временного измерения, за исключением того, что время представлено непостоянно как изменения в пространстве. Если вы заметили в (b), даже в периоды совместной работы спайки могут быть не совсем синхронными. Если животное движется, точки находятся в другом пространстве. Опять же, это также схематические данные, нанесенные на график, чтобы дать вам представление о том, что происходит; в реальных данных у вас может быть на тысячи точек больше, и это может затруднить чтение цифры.
Путаница в построении ментальной карты крысы
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v