Существует ли общедоступная база данных микробов, в которой указаны их отходы и химические источники пищи в дополнение к другим характеристикам.
Чтобы я мог заняться поиском микробов, которые питаются аммиаком или выделяют серную кислоту?
Кажется, я не могу найти это в Google.
Вы можете попробовать заглянуть в базу данных кеггов . Его основная цель - описать биохимические пути, но он также содержит информацию о том, какие виды на самом деле имеют эти пути (хотя не уверен, насколько хорошо эта аннотация подходит для бактерий).
Вы должны быть в состоянии определить несколько ключевых путей, которые начинаются со свободного аммиака или имеют серную кислоту в качестве поглотителя/конечной точки, а затем проверить наличие всех аннотированных видов. Я бы не ожидал, что такие списки будут исчерпывающими, но они должны дать вам хотя бы отправную точку.
В качестве примера подпути нитрификации и анаммокса на странице метаболизма азота показывают прямое использование/включение свободного аммиака. Если вы нажмете на некоторые из ферментов/генов (поля с цифрами) и перейдете к полю «таксономия» под генами, вы получите список некоторых видов бактерий для каждого.
Составьте список всех названных видов бактерий ( Бактерии I. Таксономия: роды и виды ) и выполните поиск в Интернете по названиям видов и ключевым словам, которые вас интересуют. Кроме того, соберите все описания видов бактерий, перейдя по ссылкам в Бактерии I. Таксономия: роды и виды , и выполните поиск описаний по интересующим вас ключевым словам.
Обратите внимание, что существует более 16 095 названных видов бактерий. . . Я создаю базу данных описаний видов бактерий, но это гигантское (многолетнее) предприятие, и я начал его всего несколько месяцев назад. Между тем, если вы можете получить доступ к «Руководству по систематической бактериологии» Берджи , там вы можете найти описания многих (но не всех) видов бактерий.
скоро
пользователь37894