Когда синтезируются нити ДНК и начинают их «соединять», как быстро она становится спиралью?
В этом ответе канадец говорит
Спиральная структура более стабильна, чем «прямая» форма (из-за взаимодействий стекинга оснований), и поэтому она формируется спонтанно.
Это наводит меня на мысль о следующем сценарии: скажем, кто-то конструирует две нити ДНК из дезоксирибонуклеотидов. Затем их начинают соединять водородными связями. До того, как будут добавлены водородные связи, я понимаю, что две нити будут прямыми, а не спиральными (если это неправильно, пожалуйста, поправьте меня в этом), поэтому в какой-то момент, когда две нити соединятся, они «самопроизвольно» станут спиральными.
Тогда вопрос в том, в какой момент. После одного "соединения"? Два? Все соединения, необходимые для завершения фрагмента ДНК?
В общем , одноцепочечная нуклеиновая кислота является спиральной в отсутствие другой вторичной структуры. Укладка оснований, которая приводит к образованию спирали, действительно происходит между соседними основаниями в одной цепи. Обратите внимание, однако, что такие структуры являются динамическими и зависят от таких свойств, как температура и концентрация соли. Вы можете увидеть пример одноцепочечной спирали РНК в следующей кристаллической структуре ( 1MHK ):
Обратите внимание, что синяя спираль внизу изображения на самом деле является дуплексом в кристалле.
канадец
канадец
Дэйвид