В какой момент при соединении нити ДНК становятся спиралью?

Когда синтезируются нити ДНК и начинают их «соединять», как быстро она становится спиралью?

В этом ответе канадец говорит

Спиральная структура более стабильна, чем «прямая» форма (из-за взаимодействий стекинга оснований), и поэтому она формируется спонтанно.

Это наводит меня на мысль о следующем сценарии: скажем, кто-то конструирует две нити ДНК из дезоксирибонуклеотидов. Затем их начинают соединять водородными связями. До того, как будут добавлены водородные связи, я понимаю, что две нити будут прямыми, а не спиральными (если это неправильно, пожалуйста, поправьте меня в этом), поэтому в какой-то момент, когда две нити соединятся, они «самопроизвольно» станут спиральными.

Тогда вопрос в том, в какой момент. После одного "соединения"? Два? Все соединения, необходимые для завершения фрагмента ДНК?

Да, в целом правильно.
Скоро сделаю, рад, что помогло.
@canadianer ответил на ваш вопрос, но вы должны знать, что он не представляет большого интереса для ученых из-за его гипотетического характера и невозможности экспериментальной проверки, а также того факта, что он не решает проблему биологических или физических наук. ДНК полимеризуется ферментами, и мы кое-что понимаем, что происходит в этих реакциях. Мы также знаем, что для белков не существует проблемы фолдинга. Мы не можем добавить дезоксинуклеотиды к уже существующей спирали (которая включает в себя создание фосфодиэфирных связей) так, как вы предлагаете, без ферментов, матрицы и праймера.

Ответы (1)

В общем , одноцепочечная нуклеиновая кислота является спиральной в отсутствие другой вторичной структуры. Укладка оснований, которая приводит к образованию спирали, действительно происходит между соседними основаниями в одной цепи. Обратите внимание, однако, что такие структуры являются динамическими и зависят от таких свойств, как температура и концентрация соли. Вы можете увидеть пример одноцепочечной спирали РНК в следующей кристаллической структуре ( 1MHK ):

введите описание изображения здесь

Обратите внимание, что синяя спираль внизу изображения на самом деле является дуплексом в кристалле.