Веб-инструменты для документирования исследований?

Open Science Framework сделает часть того, о чем вы просите . Кроме того, это позволит вам предварительно зарегистрировать свои гипотезы, чтобы правильно различать подтверждающие и поисковые исследования.

Особенности (цитата с домашней страницы).

• Документальные и архивные исследования
• Делитесь и находите материалы, сценарии, данные
• Подробно об отдельных вкладах
• Повышение прозрачности
• Материалы с отметками времени

Мне нравится твой вопрос. Но я должен отметить одну вещь: если бы вы использовали инструменты документирования для всех тех задач, которые вы упомянули, у вас не осталось бы столько времени для ваших исследований. Делиться — это здорово, но для того, чтобы сделать это правильно, требуется время, даже с помощью отличных инструментов.

Я испробовал довольно много инструментов для документирования исследований, чтобы повысить свою производительность, увеличить объем записываемой информации и поделиться информацией для критики коллег. В конце концов, уцелела лишь горстка этих инструментов. Выжили те, которые плавно интегрировались в мою повседневную жизнь, в основном с точки зрения экономии времени и простоты интерфейса.

Для лабораторных заметок, быстрых мыслей, жестоких набросков, небольших мозговых штурмов и быстрых каракулей на конференциях победителем является бумажный блокнот хорошего качества . Лично я являюсь поклонником коричневой переработанной бумаги Paperchase формата A5 с переплетом Wiro, которую я всегда использую с тонкой ручкой Pilot с черными чернилами. Я знаю, ОКР, но в хорошем смысле. Коричневая бумага придает винтажность моим заметкам, что меня как-то стимулирует, и мне нравится возвращаться к ней и хранить ее. Я пробовал альтернативы, но они никогда не могли сравниться с оберточной бумагой в переплете. Ручка Livescribe была слишком большой, с уродливыми чернилами и не обладала плавностью экспорта программного обеспечения, и в итоге она стала просто диктофоном, хотя и редко. Приложения для создания заметок на iPad, такие как Noteshelf или Penultimateсо стилусом Pogo меня сильно тормозило, снова ужасно писал, а батарея всегда садилась посреди важного семинара.

Я часто делаю снимки своего бумажного блокнота с помощью Evernote с помощью iPhone. На самом деле я делаю снимки многих других вещей с помощью Evernote , и это, безусловно, очень простая и отличная платформа для хранения и обмена, которая без проблем работает как на настольном компьютере, так и на мобильном устройстве.

Для сырых данных — Dropbox . Теперь также Google Drive , как вы указали, но Dropbox был первым с облачным, сверхпростым в настройке решением для хранения. Dropbox был большой вещью в моем наборе инструментов для документирования, поскольку он избавил меня от необходимости использовать USB-ключи. Я мог бы настроить свой эксперимент так, чтобы все необработанные данные участников автоматически сохранялись в Dropbox после эксперимента. Я вернулся домой - он ждал меня. Когда мы сотрудничали, все данные были удобно размещены в общих папках Dropbox без необходимости перемешивать электронные письма или настраивать передачу необработанных данных.

Mendeley — отличный инструмент как для управления библиографией, так и для обмена ею. Фантастическая идея, которая оказалась действительно большой и превосходит EndNote. Больше всего мне нравится в Mendeley возможность автоматизировать создание библиографий для LaTeX. Это максимальная экономия времени.

Что касается постеров, то есть новый репозиторий постеров F1000 , который я еще не пробовал, но он выглядит многообещающе.

Для анализа кода мне показалось это сложным. Да, вы можете разместить код на Github , но вы не сможете его там скомпилировать. Так что это дополнительный шаг, когда вам нужно организовать свой код на Github, описать его и т. д. Никогда не пробовал, потому что я предпочитаю тратить время на изучение кодирования, но я не говорю, что не буду пробовать это в будущем. , когда я почувствую, что у меня есть более ценный код, которым я могу поделиться с сообществом.

Для презентации я некоторое время играл с Prezi, у которого есть отличная возможность легко делиться своими презентациями. Но в конце концов я отказался от него после того, как люди пожаловались на укачивание, и после того, как я почувствовал, что потерял какой-то ключевой фактор простоты. Я присматриваюсь к Beamer , но сейчас нет времени, поэтому Keynote должно хватить.

По поводу обсуждения, чата, интеллигентного монолога - опять же зависит от того, чего вы хотите этим добиться. Поделитесь трюком кодирования при анализе некоторых данных? Обсудить интересные данные? Или написать страницу о ваших подходах к документированию инструментов? Во всех случаях это требует времени, поэтому хорошо убедиться, что вы не делаете этого, чтобы не заняться чем-то более важным. Существует множество инструментов для онлайн-дискуссий и ведения блогов. Мне нравится это здесь, в Stack Exchange, потому что это чисто сообщество, и очень легко собрать слишком длинный кусок разглагольствования по многим темам ;-)

Figshare — это один из вариантов архивирования различных артефактов исследований. Чтобы процитировать «о странице» :

figshare позволяет исследователям публиковать все результаты своих исследований за считанные секунды в удобной для цитирования, совместного использования и обнаружения форме. Все форматы файлов могут быть опубликованы, включая видео и наборы данных, которые часто переводятся в раздел дополнительных материалов в текущих моделях публикации. Открыв процесс рецензирования, исследователи могут легко публиковать нулевые результаты, избегая эффекта ящика с файлами и помогая сделать научные исследования более эффективными. figshare использует лицензирование Creative Commons, чтобы обеспечить беспрепятственный обмен исследовательскими данными, позволяя пользователям сохранять свое право собственности. figshare бесплатно предоставляет пользователям неограниченное общедоступное пространство и 1 ГБ личного хранилища.

Несколько вещей, которые мне нравятся в figshare:

• Лицензия Creative Commons
• У них есть какая-то форма архивной политики, в которой говорится, что если они прекратят свою деятельность, резервная копия контента будет сохранена у другого поставщика. Однако это не так открыто, как обмен стеками, поскольку они не делают общедоступными резервные копии всего сайта.
• Объекты получают цитируемую дои
• Просмотр и обмен статистикой для общих объектов

На сайте http://psychfiledrawer.org/ также рассматриваются некоторые аспекты того, о чем вы спрашиваете. В основном он предназначен для поддержания общедоступного хранилища попыток воспроизведения психических экспериментов.

Многие лаборатории, которые я знаю, используют Basecamp . Это стоит денег, но предоставляет централизованное место для хранения всей перечисленной вами информации и позволяет комментировать все это, а также календарь для координации вашей команды .