Где найти данные об экспрессии генов E.coli?

Я ищу данные экспрессии всего генома E.coli с различными условиями, любое предложение приветствуется. Условием может быть, например, разная температура выращивания, разные среды и т. д. Я пробовал GEO, но он дает только список, и нужно читать все страницы и образцы один за другим, чтобы увидеть, какие условия использовались.

Что вы имеете в виду под "другим состоянием"? GEO — это база данных, в которой хранятся данные об экспрессии генов, поэтому здесь не место для поиска полных геномов. Если вместо этого вы ищете данные об экспрессии генов, адаптируйте свой вопрос. Информацию о различных полных геномах E.coli можно найти здесь.
@ Крис, я изменил свой вопрос
Вы ищете что-то, что даст вам список генов, экспрессирующихся в определенных условиях?
вы можете запустить автоматический запрос GEO и получить номера доступа GEO для тех, которые соответствуют вашим ключевым словам.
Если вас интересуют данные секвенирования, выполните поиск в NCBI-SRA.
@WYSIWYG, не могли бы вы привести пример, как его запустить и как его получить?
@Немо см. здесь . Вы должны построить поиск на основе ваших ключевых слов и упомянуть базу данных. Затем вам нужно просмотреть полученный список информации, чтобы выбрать, какие из них вам действительно нужны. Затем вы можете загрузить данные, соответствующие этим экспериментам, аналогичным образом. Смотрите это тоже. Если у вас есть конкретные сомнения по этому поводу, опубликуйте их как новые вопросы.

Ответы (1)

Есть несколько баз данных, в которых вы можете искать данные об экспрессии генов E.coli :

Чтобы узнать о целях и условиях экспериментов, стоящих за этими наборами данных, вам придется прочитать соответствующие публикации.

не могли бы вы опубликовать несколько примеров документов, сделанных для данных экспрессии генов кишечной палочки, если вам известны какие-либо
Где найти данные об экспрессии генов E.coli?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v