Я хотел бы спросить, существует ли какой-либо метод (установленный или нет) для количественной оценки гетерогенности, обнаруженной в мутациях, возникающих в первичных новообразованиях и метастатических поражениях (как обычных, так и частных), и потенциальной корреляции этого числа со стандартными клинико-патологическими признаками.
Методы, которые сразу приходят на ум, в основном связаны с секвенированием нового поколения . Вы можете выполнить глубокое секвенирование своего образца, которое просто максимально увеличивает охват, чтобы найти редкие события. Вы можете выполнить РНК- секвенирование для просмотра транскриптома, ChIP- секвенирование для просмотра модификаций хроматина и секвенирование отдельных клеток (форма глубокого секвенирования, действующая на отдельных клетках) для получения данных о каждой клетке, либо из геном (ДНК) или транскриптом (РНК).
Если вы смотрите исключительно на фенотипы, проточная цитометрия весьма полезна для анализа относительных уровней экспрессии белков с использованием как внеклеточных, так и внутриклеточных маркеров и красителей. FACS — это расширение проточной цитометрии, которое позволяет сортировать различные клеточные популяции в отдельные контейнеры. Затем эти «очищенные» образцы можно использовать в любом из перечисленных выше методов.
WYSIWYG