В моей книге написано, что когда молекула связывается с белком-носителем, белок вращается и высвобождает молекулу внутри клетки. Я хочу знать, как это возможно. Не будут ли окружающие молекулы фосфолипидов или других белков препятствовать его вращению?
РЕДАКТИРОВАТЬ
Ось вращения находится в плоскости мембраны
Источник: http://ncert.nic.in/ncerts/l/kebo111.pdf (стр. 177, третий абзац)
«Как транспортные/переносящие белки вращаются во время облегченной диффузии?»
Они не делают. Объяснение в PDF-файле, который вы связали...
На рис. 11.1 показана внеклеточная молекула, связанная с транспортным белком; затем транспортный белок вращается и высвобождает молекулу внутри клетки.
... является, по меньшей мере, чрезмерным упрощением (вы можете просто сказать, что это совершенно неправильно). То, что происходит на самом деле, намного сложнее.
Мы называем это конформационным изменением .
Согласно Альбертсу, Молекулярная биология клетки (2002):
Каждый тип белка-носителя имеет один или несколько специфических сайтов связывания с растворенным веществом (субстратом). Он переносит растворенное вещество через липидный бислой, претерпевая обратимые конформационные изменения , которые поочередно обнажают сайт связывания растворенного вещества сначала на одной стороне мембраны, а затем на другой. (выделено мной)
Это изображение, которое намного лучше объясняет процесс, из той же главы в Альберте (легенда дает подробное объяснение):
Рисунок 11-11А модель молекулярного механизма действия бактериальной лактозопермеазы (А) Вид из цитозоля на предполагаемое расположение 12 предсказанных трансмембранных спиралей в мембране. Петли, соединяющие спирали по обе стороны мембраны, для ясности опущены. Глутаминовая кислота на спирали X связывает H+, а аминокислоты, поступающие от спиралей IV и V, связывают лактозу. (B) Во время транспортного цикла носитель переключается между двумя конформационными состояниями: в одном H+- и лактозо-связывающие сайты доступны для внеклеточного пространства (1 и 2); в другом они подвергаются воздействию цитозоля (3 и 4).
Таким образом, как вы можете видеть, мы имеем конформационные состояния: одно из них выставляет сайт связывания во внеклеточное пространство, а другое выставляет сайт связывания в цитозоль. Подобно тому, что происходит, когда фермент меняет конформацию, трехмерные изменения в структуре белка довольно малы, а его гидрофобные области остаются на одном и том же месте в обоих состояниях.
Источник: Альбертс Б., Джонсон А. и Льюис Дж. (2002). Молекулярная биология клетки. 1-е изд. Нью-Йорк: Гарланд Наука. .
JM97
Шиваншу Сиянвал
JM97
Шиваншу Сиянвал
JM97
Шиваншу Сиянвал
JM97
Алан Бойд
Шиваншу Сиянвал