Как я могу преобразовать стопку изображений с возрастающей интенсивностью в масштаб, который позволит людям увидеть разницу в интенсивности?

У меня есть множество стеков tiff с камеры с подключенной ПЗС, я наблюдаю увеличение интенсивности моего стека изображений по сравнению с изменением концентрации, проблема, с которой я сталкиваюсь, заключается в том, что это изменение, хотя четко показано на моем графике от среднего значения пикселя этих изображений, но когда рядом находятся наиболее и наименее интенсивные изображения, эту прогрессию почти невозможно увидеть.

Мне интересно, есть ли какие-либо функции ImageJ или другие бесплатные программы, которые будут преобразовывать эти изменения интенсивности так, чтобы разница была видна человеческому глазу.

Можем ли мы увидеть пару из них, которые иллюстрируют ваш вопрос?
Говорит ли он о наложении/брекетинге HDR?
В предыдущем вопросе он упоминает «использование флуоресцентного микроскопа с ПЗС». Я предполагаю, что это та же установка.
Когда вы говорите о стеке, вы имеете в виду гиперстек MSI/HSI или 3D (x/y/_/t) стек? Вы пытаетесь измерить общий вклад (кумулятивная гистограмма IE) или пытаетесь измерить дельту H (изменение IE с течением времени?) ImageJ определенно может делать то, что вам нужно, но нам нужны более подробные сведения о вашем процессе.
@PhotoScientist Мне было бы интересно прочитать об обоих, если вы напишете об этом ...
@xiota, как вы думаете, это по теме, или мне следует задать свой собственный вопрос?
@PhotoScientist Я ничего не знаю о гиперстеке, кумулятивной гистограмме или дельте H, поэтому я хотел бы прочитать об этом 😛 Поскольку вы упомянули об этом как о возможности для этого вопроса, я думаю, что это было бы хорошо в качестве ответа. здесь. Если вы напишете это как отдельный вопрос, чем он будет отличаться от этого вопроса?

Ответы (1)

Я не понимаю, что вы делаете или описываете, поэтому этот ответ, вероятно, будет пересмотрен, если появится дополнительная информация.

В пределах одного изображения, если есть градиент, который трудно увидеть, мы можем расширить его диапазон, используя уровни или кривые . Например, если у нас есть 10-ступенчатый градиент от 45 до 55, может быть трудно увидеть разницу между 50 и 51. Но если мы растянем его на диапазон от 0 до 100, разницу между 50 и 50 будет легче увидеть. 60.

Кажется, вы хотите что-то, что будет делать это с «градиентом» изображений вместо пикселей ?

  • Вы можете написать скрипт, который вызывает ImageMagick (возможно, изменяя яркость, контрастность или гамму). Будет ли это работать, зависит от характера различий, которые вы хотите сделать видимыми.

  • Если изображения будут отображаться на мониторе, можно использовать интерфейс, в котором пользователь может сравнивать изображения, переключаясь между ними.

  • Чтобы графически проиллюстрировать различия, не манипулируя самими изображениями, вы можете показать «колоду» миниатюр, распределенных по градиенту, с выноской к более крупному изображению с ключевыми областями, обведенными кругом и подписанными. Затем не забудьте четко указать: «Только для иллюстрации».

  • Основываясь на вашем предыдущем вопросе о ПЗС и гамме , если различия трудно увидеть, потому что они представлены линейно, может быть приемлемо их гамма-коррекция , если вы отмечаете, что это то, что вы сделали. (Например, если вы фотографируете гели для электрофореза.)

  • Стоит отметить, что если изображения предназначены для научной публикации, манипуляции с изображениями могут быть неприемлемы .  Если единственное различие заключается в относительной «яркости» изображений, манипулирование изображениями может рассматриваться как нечестное, поскольку само по себе манипулирование привело бы к разнице в яркости.

Как я могу преобразовать стопку изображений с возрастающей интенсивностью в масштаб, который позволит людям увидеть разницу в интенсивности?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v