Какой организм имеет наименьшую длину генома?

Поскольку вы сказали растение/животное/что угодно, я предлагаю самые маленькие геномы в различных категориях...

(Кб означает Килобазы, Мб означает Мегабазы. 1 Кб = 1000 пар оснований, 1 Мб = 1000 Кб)

• Самый маленький геном растения: Genlisea margaretae размером 63 Мб ( Greilhuber et al., 2006 )
• Наименьший геном животного: Pratylenchus coffeae (червь-нематода) размером 20 Мб (база данных размера генома животного )
• Геном самого маленького позвоночного: Tetraodon nigroviridis (рыба-фугу) размером 385 Мб ( Jailon et al., 2004 )
• Самый маленький эукариот: Encephalitozoon cuniculi (микроспоридии) размером 2,9 Мб ( Vivarès & Méténier, 2004 )
• Наименьший геном свободноживущих бактерий: Nanoarchaeum eqitans размером 491 КБ ( Waters et al., 2003 )
• Наименьший бактериальный геном: Carsonella ruddii (эндосимбионт) размером 160 КБ ( Nakabachi et al., 2006 )
• Самый маленький геном из всех: цирковирус размером 1,8 КБ (всего 2 белка!!) ( Chen et al., 2003 )

Ссылки...

• Чен, К.-Л., Чанг, П.-К., Ли, М.-С., Шиен, Дж.-Х., Оу, С.-Дж. & Shieh, HK (2003) Нуклеотидные последовательности гусиного цирковируса, выделенного на Тайване. Патология птиц: журнал WVPA 32 (2), 165–171.
• Грейлхубер, Дж., Борш, Т., Мюллер, К., Ворберг, А., Порембски, С. и Бартлотт, В. (2006) Наименьшие геномы покрытосеменных, обнаруженные у Lentibulariaceae, с хромосомами бактериального размера. Биология растений. 8 (6), 770–777.
• Жайон, О., Ори, Ж.-М., Брюне, Ф., Пети, Ж.-Л., Штанге-Томанн, Н., Маусели, Э., Буно, Л., Фишер, К., Озуф- Костаз К., Бернот А., Нико С., Яффе Д., Фишер С., Лутфалла Г. и др. (2004) Дупликация генома костистых рыб Tetraodon nigroviridis выявляет ранний протокариотип позвоночных. Природа. 431 (7011), 946–957.
• Накабачи, А., Ямасита, А., Тох, Х., Исикава, Х., Данбар, Х.Е., Моран, Н.А. и Хаттори, М. (2006) Геном бактериального эндосимбионта карсонеллы размером 160 килобаз. Наука. 314 (5797), 267–267.
• Виварес, К.П. и Метенье, Г. (2004) Оппортунистические инфекции: токсоплазма, саркоцистис и микроспоридия. В: Паразиты мирового класса. Спрингер США. стр. 215–242.
• Уотерс, Э., Хон, М.Дж., Ахель, И., Грэм, Д.Е., Адамс, М.Д., Барнстед, М., Бисон, К.Ю., Биббс, Л., Боланос, Р., Келлер, М., Кретц, К. , Lin, X., Mathur, E., Ni, J., et al. (2003) Геном Nanoarchaeum equitans: взгляд на раннюю эволюцию архей и производный паразитизм. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (22), 12984–12988.

Я хочу сказать Mycoplasma genitalium с размером генома 582 970 п.н. Оказывается, ответ Nanoarchaeum eqitans с геномом 490 885 п.н.

http://en.wikipedia.org/wiki/Наноархеум

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14566062

И Mycoplasma genitalium , и Nanoarchaeum equitans являются облигатными паразитами/эндосимбионтами. Это означает, что они в значительной степени зависят от своего хозяина для поддержания своих жизненных функций, и они потеряли многие из своих собственных генов.

По-настоящему свободноживущим организмом с крайне малым геномом (~1309 т.п.н., 1354 гена) является гетеротрофная морская альфа-протеобактерия Pelagibacter ubique [1].

Более подробный анализ смотрите здесь: https://alamot.github.io/smallest_genome/

[1]: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16109880 Giovannoni SJ, Tripp HJ, Givan S, Podar M, Vergin KL, et al. (2005). «Упорядочение генома космополитической океанической бактерии». Наука 309: 1242–1245.

Наименьший геном свободноживущих бактерий: Nanoarchaeum eqitans размером 491 КБ (Waters et al., 2003). Я скачал эту статью, в ней говорится, что это археи и их обязательный симбионт, а не свободноживущие бактерии. Пожалуйста, внимательно прочитайте, а затем загрузите его.