Какова последовательность ДНК яблока?

Я читал, что был нанесен на карту геном Malus Domestica , но нигде не могу найти последовательность.

Если это глупый вопрос, я был бы признателен, если бы вы сказали мне, где я неправ в этом!

Погуглил "последовательность генома malus domestica". Первым результатом была эта статья , которая включает эту запись в банке геномов (которая также является вторым результатом поиска)
@Luigi Спасибо, но я не знаю, как разобраться в записи в банке геномов.
Если все, что вам нужно, это загрузить последовательность всех хромосом, посмотрите на сборку гаплотипов . Загрузите первый файл (psuedomolecules) и разархивируйте его. Тогда у вас будет последовательность каждой хромосомы в формате FASTA.

Ответы (2)

https://www.rosaceae.org/species/malus/malus_x_domestica/genome_v1.0

Вы можете увидеть данные в URL-адресе выше. Подробности описаны в этой статье .

Как говорили другие, NCBI кажется полезным. Зайдите на этот сайт . Выберите хромосому, которую хотите просмотреть, и щелкните генбанк или повторную последовательность, соответствующую хромосоме в таблице (Единица сборки: Первичная сборка). Вы можете увидеть обзор последовательности. Найдите FASTA на странице с обзором и нажмите FASTA. Затем данные последовательности будут загружены.

Спасибо, я просмотрел приведенную выше ссылку, но я все еще не вижу последовательность нуклеотидов ДНК.
Данные последовательности показаны как rosaceae.org/gb/gbrowse/malus_x_domestica . Вы можете извлечь последовательности из этого. Но я не использовал этот конкретный сайт. По крайней мере, вы можете увидеть контингентные последовательности, обозначенные красным, щелкнув красные области, например rosaceae.org/gb/malus_details?id=1311210 .
Спасибо за вашу помощь. Я использовал базу данных ДНК на сайте ncbi.nlm.nih.gov , чтобы найти ответ.

Вот геном яблока на NCBI.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Apple

Сколько существует рядов нуклеотидных последовательностей?
Все ли строки последовательности необходимы?
Какова последовательность ДНК яблока?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v