Стандартизированный коэффициент выбора (SSR)

В этой статье авторы использовали стандартизированный коэффициент отбора (SSR), чтобы сделать вывод о том, что является предпочтительным хозяином (анемон) для рыбы-анемоны.

Вот цитата из их методов:

  The “preferred host” of anemonefish was assessed calculating the “Standardized
Selection Ratio (SSR)” (values between 0 and 1) (Manly et al. 1993). Manly’s standardized
selection ratio represents the probability that an individual will use a particular habitat
type, taking into account the different resource availability. For each anemonefish species (i) inhabiting an anemone species (j), SSR was calculated as:

С С р "=" ж я ж Дж

где ж я "=" о я п Дж

    `Oi` is the relative frequency of the anemonefish species i and `pj` the relative frequency
of the anemone species j. Higher values of SSR indicate a strong preference for the
selected resource. The Log- Likelihood statistic (χ2L) (Manly et al. 1993) was used to
check the significance of the observed distribution under a null hypothesis of a random
host choice.

Вот книга, которую они цитируют (Manly et al. 1993).

Можете ли вы помочь мне понять в основном, что они сделали и как они рассчитали свои значения SSRи p.values. Если ж я "=" о я п Дж чему wjравно?

Ответы (1)

Я понимаю, почему вы можете быть сбиты с толку! Авторы выбрали плохую нотацию, так как то, как они ее написали ж я явно зависит не только от выбора видов аненомовых рыб я но и на выбор видов анемонов Дж . И непонятно, как именно они выполняют свою сумму в определении SSR: суммируют по всем возможным парам видов аненома-аненомефиш или только по всем видам аненомофиш? Первое имеет смысл, но крайне неясно, а второе не имеет смысла, потому что нет никакого способа интерпретировать это как вероятность того, что аненомная рыба выберет определенный аненом, потому что сумма SSR для всех различных видов аненом не обязательно будет быть равно 1, поэтому вероятность того, что виды аненомовых рыб выберут какой-либо вид аненомных рыб, не будет равна 1!

ПРИМЕЧАНИЕ. Ссылка на Manly 1993 неверна (вы процитировали статью 1995 года); на самом деле они цитируют книгу: Manly B, McDonald L, Thomas D (1993) Выбор ресурсов животными. Статистический дизайн и анализ для полевых исследований . Чепмен и Холл, Лондон. Это, вероятно, было бы лучшим местом для поиска, чтобы получить точный ответ на ваш вопрос. Я думаю, что это было бы лучшим местом для поиска в первую очередь.

Спасибо! Я исправил проблему с книгой Manly et al.