Я хотел использовать compana()функцию из adehabitatпакета в R. Я не очень понимаю значение данных в примере, который они предоставляют (из aebisher et al., 1993).
Два основных аргумента companaфункции:
compana(используется, используется, другие.аргументы…)
использовали
матрицу или фрейм данных, описывающий процент использования местообитаний (в столбцах) животными (в строках).воспользуйтесь
матрицей или фреймом данных, описывающим процент доступности мест обитания (в столбцах) по животным (в строках).
Что значит...
«[..] кадр данных, описывающий процент доступности мест обитания для животных»
иметь в виду ?
Под «наличием среды обитания», я думаю, имеется в виду доля этих мест обитания, которые не использовались. Не так ли? Но тогда как это можно разделить на разные виды?
Думаю, мне не хватает чего-то простого в функционировании этого статистического инструмента!
Можно запустить это в R, чтобы получить больше информации:
install.packages("adehabitat")
require(adehabitat)
?compana
# The following code comes from the example provided in the help page
data(pheasant)
pheasant$mcp
pheasant$studyarea
compana(pheasant$mcp, pheasant$studyarea,
test = "parametric")
Не уверен на 100%, но могу предположить следующее:
«используется» — это процент времени, проведенного в определенной среде обитания, а «используется» — это количество этой среды обитания, с которой конкретное животное сталкивается в своей жизни. Этот пример объясняет, что я имею в виду:
Скажем, у вас есть какой-то суслик, который живет в скалистом обнажении (R). Рядом с дырой находится поле (F), а через поле несколько деревьев (T) с едой для белок. Белка проводит все свое время в этих трех местах обитания, но ей не очень нравится поле, потому что оно открыто и может быть атаковано хищниками, поэтому, когда она выходит за едой, она быстро бежит через поле, добывает пищу и убегает. назад. Скажем, он проводит 60 % своего времени дома, 10 % бегает по полю и 30 % времени ест на деревьях. Они дают вам ваши «использованные» номера. Но относительная доля мест обитания, которые когда-либо занимала белка (относительный размер), сильно различается. По площади поле составляет 75 %, деревья — 15 %, скалы — 10 %. В этом примере ваша «используемая» матрица будет выглядеть так:
used
R F T
Squirrel 0.6 0.1 0.3
и ваша «доступная» матрица будет выглядеть так:
avail
R F T
Squirrel 0.1 0.75 0.15
С помощью этой информации вы можете сделать статистику, чтобы проверить, выбирает ли белка места обитания случайным образом или предпочитает определенные. Если бы он случайным образом выбирал места обитания, можно было бы ожидать, что проценты «используемых» будут выглядеть как проценты «доступных», т. е. он проводит около 75% своего времени в поле, потому что просто бесцельно бродит между камнями, полем и деревьями. Но поскольку вы наблюдаете довольно значительное увеличение времени, проводимого в малодоступных местах обитания, вы, вероятно, заметите статистически значимое предпочтение определенных мест обитания (точно камни и, возможно, деревья).
Затем, если у вас есть несколько видов, эта программа, вероятно, проверяет, насколько похожи модели предпочтения и избегания среды обитания двух видов, и использует это для определения перекрытия ниш. «Полезность» может быть одинаковой, если они оба путешествуют по одним и тем же камням, полям и деревьям, но если другой вид имеет большую площадь кормления, его проценты F и T в матрице «полезности» будут увеличиваться по сравнению с R.
Опять же, не совсем уверен в этой интерпретации, но мне кажется, что это имеет смысл из документации R.