Я всегда думал, что «аллель» просто означает вариант гена и, таким образом, может использоваться в контексте как бесполых, так и половых популяций. При этом он лишь немного менее полезен в качестве концепции бесполого пола из-за отсутствия рекомбинации и, следовательно, отсутствия перетасовки аллелей среди потомства. Недавно я читал газету , в которой было написано:
В упомянутых ранее бесполых и половых популяциях имплицитное модельное пространство представляет собой просто точку в частотном пространстве генотипа или частотном пространстве аллеля, соответственно.
Предполагая, что аллели следует в первую очередь использовать в контексте половых популяций. Википедия дает общее определение, согласующееся как с асексуальным, так и с сексуальным использованием, но все перечисленные примеры являются сексуальными.
Отсюда мой терминологический вопрос:
Должен ли я использовать слово «аллель» для вариантов генов только в случае половых популяций? Или можно использовать «аллель» в популяциях облигатных асексуалов?
Я понимаю, почему рекомбинация заставляет нас представлять всю популяцию как частоту аллелей вместо того, чтобы говорить об отдельных генотипах, и почему асекс позволяет нам сосредоточиться только на последнем. В этом вопросе меня не интересует это различие, просто чисто терминологический вопрос.
Нет, его можно использовать и для асексуалов. В термине «локус» для асексуалов есть двусмысленность, но «аллель» подойдет, а «ген» не намного более неоднозначен, чем для сексуалов (что мало что говорит).
Однако ваш последний абзац кажется запутанным, и я думаю, что он связан с вашим основным вопросом. Когда рекомбинация происходит достаточно часто, чтобы поддерживать популяцию в равновесии по сцеплению, это позволяет нам представить популяцию просто как точку в пространстве частот аллелей, а не в полном, экспоненциально большем пространстве генотипов. Таким образом, Уотсон и Сатмари используют разные термины для этих двух случаев не потому, что они не могут использовать «аллель» в бесполом контексте, а потому, что аллелей недостаточно для описания бесполой популяции.
В целом половые популяции не находятся в равновесии по сцеплению и не могут быть просто описаны частотами аллелей, как отмечает W&S далее в этом абзаце.
Артем Казначчеев
Дэниел Вайсман