Вы изучаете клеточную передачу сигналов через недавно идентифицированный GPCR. В частности, вы работаете над парой недавно выявленных GPCR, GPCR-A и GPCR-B. Каждый связывает один и тот же малый лиганд, но активирует разные гетеротримерные G-белки, действующие на аденилатциклазу.
Ваш наставник-аспирант объясняет, что и рецепторы, и субъединицы Gα и Gβγ гетеротримерных G-белков связаны с мембраной. Вы исследуете последовательности семи предсказанных трансмембранных α-спиралей GPCR-B. Вы удивитесь, обнаружив, что в этих спиралях есть гидрофильные аминокислотные остатки. Как вы можете объяснить это наблюдение?
Это был вопрос викторины Массачусетского технологического института. У меня есть свои предположения. Но я хотел знать правильный ответ.
Что ж, поскольку GPCR являются трансмембранными белками, обычно трансмембранные спирали имеют более высокие гидрофобные аминокислоты или только гидрофобные, неполярные аминокислоты. Здесь говорится, что они видели какие-то полярные остатки. Ну, я предполагаю, что, поскольку есть два GPCR a и b, которые связываются с одним и тем же лигандом, может случиться так, что один активирует стимулирующий G-белок, а другой - ингибирующий G-белок Gi. Так что, вероятно, полярные аминокислоты, которые находятся в трансмембранном сегменте альфа-спирали стимулирующего GPCR, немного смещены и находятся во внутриклеточной области тормозного GPCR (Gpcr, который активирует ингибирующий G-белок). Чтобы находиться во внутриклеточной области, он должен быть гидрофильным. Это все, о чем я могу думать.
Любая помощь с этим вопросом очень ценится. Для меня это не вопрос домашнего задания. Я не хожу в Массачусетский технологический институт. Я просто хотел укрепить свои концепции.
Полярные аминокислоты в этом случае стабилизируют спиральную структуру в неполярной среде мембраны, образуя внутри- и межспиральные связи. Таким образом, боковые цепи полярных аминокислот поворачиваются друг к другу, в то время как аполярные аминокислоты обращены к аполярной мембране. Это определенно подтвердилось бы, если бы вы могли найти чередующиеся аполярные и полярные сегменты в последовательности спиралей.
Любопытный
Любопытный