аутосомно-рецессивная численность населения

Этот вопрос является фоновым исследованием для научно-фантастического / фэнтезийного романа, мои знания в области генетики очень базовые.

Мне кажется очевидным, что для генетических нарушений, которые являются аутосомно-рецессивными, если эти расстройства препятствуют размножению пораженных особей, процент носителей и больных в популяции, естественно, будет меньше. Я не уверен, что это единственная причина, по которой говорят, что голубые глаза встречаются чаще, чем кистозный фиброз, но это определенно является одним из способствующих факторов.

Мой вопрос таков: скажем, у вас есть (вымышленный) аутосомно-рецессивный признак, который не препятствует размножению. Назовем начальный уровень носителей в популяции для этого признака C и начальный уровень пораженных A .

В случае, если это имеет значение, вымышленная черта, которую я рассматриваю, может снизить вероятность размножения (поскольку людей могут избегать или считать менее желательными в качестве партнера), но ничто не препятствует размножению. Что-то вроде «ярко-фиолетовые волосы», когда есть клеймо в отношении пострадавших людей — «ваши волосы отмечают вас как испорченного» или что-то в этом роде. Я думаю, что A составляет около 0,1% (1 на 1000 рождений). (И если я правильно понимаю математику, тогда C будет около 6%, или 1 из 16, так что это C * C / 4дает A .)

Теперь предположим, что репрессивное правительство решает помешать размножаться всем затронутым особям (но носители остаются в покое). Давайте предположим, что правительство со 100% успехом делает пострадавших людей бесплодными, тем самым предотвращая их размножение. Что произойдет с C и A со временем? Есть ли какой-нибудь простой способ оценить, как они изменятся в течение нескольких поколений? Мне не нужны точные цифры, но мне трудно даже предположить.

Добро пожаловать в Biology.SE. Я не уверен, что понимаю вас Cи Aправильно. Это правда что C+A=1?
Извините @Remi.b, мои термины взяты из обычных вещей, таких как литература, которую дают членам семей детей, рожденных с генетическим заболеванием (у меня есть личный опыт). C — это то, что они называют «носителем», доля населения, которое является носителем. Я не уверен, является ли «показатель пораженности» реальным термином, но я имею в виду долю населения, рожденного с расстройством.
О, хорошо... так что любой человек, несущий рецессивный аллель, учитывается в частоте, Cнезависимо от того, есть ли у него заболевание, верно? Кстати, рыжие волосы - это не болезнь, как вы сказали, они могут размножаться!
О, так может быть, термины, которые я использовал, например, «носитель», больше подходят для расстройств/заболеваний? Я думал, что они достаточно общие, чтобы их можно было применить к любой черте!!
Хм, хм, да, я думаю, что люди с этой чертой действительно учитываются как часть частоты C. Но если бы это упростило объяснение/вычисление, было бы хорошо, если бы вы захотели переопределить термины, чтобы C не включала «затронутых» людей.

Ответы (1)

В популяционной генетике , используя простую модель с одним локусом и двумя аллелями , мы считаем, что частота двух аллелей равна п и д где п + д "=" 1 (и поэтому 1 п "=" д и 1 д "=" п ). Когда аллель является рецессивным, он выражается на фенотипическом уровне только тогда, когда человек несет две копии аллеля.

Следуя вашему примеру, ген А может отвечать за цвет волос с аллелями А 1 и А 2 где А 2 является рецессивным аллелем, ответственным за пурпурные волосы. Я буду обозначать частоту А 1 с п и частота А 2 с д . Это означает, что частота лиц с фиолетовыми волосами ( ф А 2 А 2 ) является д 2 и частота людей с не фиолетовыми волосами п 2 + 2 п д (при условии идеализированного населения ). Таким образом, популяция из 500 диплоидных особей * , где имеется 100 копий А 2 аллель будет иметь следующие генотипические (и фенотипические) частоты:

ф А 1 А 1 "=" п 2 "=" 0,9 2 "=" 0,81
ф А 1 А 2 "=" 2 п д "=" 2 × 0,9 × 0,1 "=" 0,18
ф А 2 А 2 "=" д 2 "=" 0,1 2 "=" 0,01

Таким образом, аллель фиолетовых волос будет присутствовать у 19% населения, но эта черта будет проявляться только у 1% (всего ~ 5,3%, т. 1 19 , людей, несущих аллель пурпурных волос, проявляют эту черту). Следовательно, отбор был бы совершенно неэффективен для удаления этого аллеля из популяции, даже если бы вы могли предотвратить размножение всех особей с фиолетовыми волосами. Чтобы найти частоту д требуется, чтобы дать генотипическую/фенотипическую частоту, где 1 в Икс у людей фиолетовые волосы, просто извлеките квадратный корень из 1 / Икс . Например, чтобы у 1 из 1000 человек были фиолетовые волосы.

д "=" д 2 "=" ( 1 / 1000 )

Что это означает для эволюции? Рецессивные вредные аллели очень трудно удалить из популяции, потому что при низких частотах они редко вызывают вредный эффект. Предполагая полное доминирование ( А 1 А 2 = точно так же А 1 А 1 ), обозначаемый час "=" 0 , выбор действует только на А 2 А 2 гомозиготы. Частота А 1 аллель увеличивается со скоростью 1 / ( 1 с д ) где с является относительным преимуществом в приспособленности. Мутация также может привести к появлению большего количества копий А 2 аллеля в популяции таким образом, чтобы было равновесие, уравновешенное скоростью потери в результате отбора и скоростью увеличения в результате мутации. Более того, продолжая вашу аналогию, соседняя популяция, в которой не происходит отбора с фиолетовыми волосами, может принести копии аллеля путем миграции .


Рекомендуемое дальнейшее чтение по эволюции здесь и чтение по евгенике , вероятно, будет вам интересно.

* 500 диплоидных особей = 1000 копий гена. Таким образом д "=" 100 / ( 500 × 2 ) "=" 0,1

Это очень помогает. И что еще лучше, одна из ваших ссылок привела меня к бесплатной программе PopG , которая, кажется, дает возможность исследовать эти значения во времени, выполняя при этом расчеты и графики для меня!
Только что отметил пару незначительных исправлений - в третьем уравнении, я думаю, вы имеете в виду, что q-квадрат, а не p-квадрат, равен 0,01. (извините, я не знаю, как писать уравнения) Кроме того, после того, как вы определили скорость 1/(1-sq) , я думаю, вы имели в виду «где 1-sq - это относительное преимущество в фитнесе», но я не уверен.