Что такое гаплотип MHC?

Гаплотип обычно определяется как

...группа генов внутри организма, которая была унаследована вместе от одного родителя. -- Природа

Это определение гаплотипа применимо независимо от того, представлены ли они всего несколькими генами или всеми генами на всей хромосоме.$^1$. В случае главного комплекса гистосовместимости это группа из более чем 200 генов на хромосоме 6 (Janeway et al. 2001). Набор аллелей$^1$унаследованы вместе от одного родителя в форме гаплотипа MHC. Таким образом, одно потомство наследует два разных гаплотипа MHC, по одному от каждого родителя. Различные гаплотипы с таким количеством генов помогают поддерживать генетическую изменчивость в общем комплексе, что улучшает способность организма к иммунному ответу.

Термин происходит от гаплоидного , что означает половину нормального набора хромосом. Люди, например, диплоидны , то есть у них есть две копии каждой хромосомы, одна унаследованная от матери (материнская) и одна унаследованная от отца (отцовская). Итак, когда вы наследуете только одну половину хромосомной пары, вы наследуете гаплотип.

Для общего сведения важно отметить, что гаплотип не всегда использовался для обозначения группы из двух или более генов, унаследованных вместе. Он обычно использовался как термин для обозначения последовательности нуклеотидов вместе на одной и той же хромосоме, даже если это только часть одного гена. Например, Боуэн и др. (1995) использовали митохондриальные гаплотипы для изучения миграции головоногих черепах через Тихий океан. Они использовали 350 нуклеотидов митохондриальной контрольной области . Размер контрольной области составляет более 1000 нуклеотидов, но Боуэн и его коллеги использовали только 350 нуклеотидов из части контрольной области. Это использование было очень распространено в 1990-х и начале 2000-х годов, прежде чем стало проще и дешевле секвенировать целые геномы или, по крайней мере, многие гены.

Цитатон

Боуэн, Б.В. и др. 1995. Транстихоокеанские миграции головоногих черепах (*Caretta caretta), продемонстрированные с помощью маркеров митохондриальной ДНК. Труды Национальной академии наук США 92: 3731-3734.

Джейнвей-младший, Калифорния, и соавт. 2001. Иммунобиология , 5-е издание. Гарланд Сайенс, Нью-Йорк.

Сноска

1. Точнее, это был бы набор аллелей в каждом локусе гена (местоположении гена), унаследованных вместе. Одни и те же гены наследуются от любого из родителей, но аллели (вариации гена) могут различаться у двух родителей.

Как указано в вики: «Главный комплекс гистосовместимости (MHC) представляет собой набор молекул клеточной поверхности, кодируемых большим семейством генов у всех позвоночных, которые контролируют большую часть иммунной системы. Молекулы MHC опосредуют взаимодействия лейкоцитов, также называемых лейкоцитами. (лейкоциты), которые являются иммунными клетками, с другими лейкоцитами или с клетками организма. MHC определяет совместимость доноров для трансплантации органов, а также восприимчивость человека к аутоиммунному заболеванию посредством перекрестной иммунизации. У людей MHC также называют человеческим лейкоцитарным антигеном (HLA). )".

По сути, MHC контролируют иммунную систему и работают по принципу «замок и ключ». MHC имеет специфическую клеточную поверхность, которая может связываться с чужеродными материалами, имеющими совместимый сайт связывания, и распознавать их как патогены или вредные соединения.