Я понимаю различные способы горизонтального переноса генов бактериями (трансформация, трансдукция (фаги), конъюгация (плазмиды)).
Существует ли экспериментальный метод определения того, как конкретный ген попал в хозяина (в ходе эволюции)? Например, если ген А попал в хозяина Х от вида Y, можно ли узнать, как ген А передался?
Если вы смотрите на шкалу времени эволюции, то единственным доступным источником информации является последовательность генома целевого организма. По крайней мере, некоторые из упомянутых вами методов горизонтального переноса генов оставляют в геноме характерную подпись. Например, ретровирусные частицы, внедрившиеся в геном человека, легко идентифицируются по их локальной последовательности ДНК .
Таким образом, с точки зрения эксперимента, вы должны секвенировать интересующий вас конкретный ген, а также окружающую локальную последовательность (скажем, 10 000 пар оснований ниже и выше вашего гена). По крайней мере, в некоторых случаях вы могли бы с уверенностью сказать, что «этот ген возник в результате ретровирусной инкорпорации», тогда как в других это было бы более двусмысленно.
Ссылки:
Belshaw, R. et al. Длительная реинфекция генома человека эндогенными ретровирусами. ПНАС (2004)
Ошейник Кантоны
Нандор Пока
Кальяри2005
Нандор Пока