Как E. coli может влиять на экспрессию C. elegans?

Плазмиды могут быть перенесены в E.coli . Эти трансформированные E. coli можно скармливать C. elegans для подавления экспрессии ее генов с помощью РНКи.

Как E.coli может высвобождать РНК-интерференцию для C. elegans ? Даже если мы предположим, что E. coli может проникать в клетки C. elegans как внутриклеточные бактерии, трудно представить, что РНК-интерференция выйдет из E. coli напрямую и войдет в клетки C. elegan ? В норме никакие клетки или бактерии не выделяют РНК или геномный материал за пределы своих клеток?

@Chris Есть ли способ объединить этот вопрос с этим biology.stackexchange.com/questions/38586/… ? Хотя это повторяющиеся вопросы, этот задает вопрос более четко и точно?
«Обычно никакие клетки или бактерии не выделяют РНК или геномный материал за пределы своих клеток?» Горизонтальный перенос генов у бактерий. Иммунная система человека Нейтрофилы и нейтрофильные внеклеточные ловушки...
В этом посте представлена ​​дополнительная информация о том, как дцРНК поглощается C. elegans.

Ответы (1)

Да, как ни странно, так и происходит. E. coli экспрессирует двухцепочечную шпильку РНК (под контролем индуцибельного промотора), а РНК содержит последовательность, полученную из гена C. elegans . Когда черви поедают бактерии, они перемалывают их в глотке и высвобождают содержимое клеток (включая индуцированную РНК) в кишечник червей. Клетки кишечника способны поглощать дцРНК и также транспортировать ее в другие клетки. Путь РНК-интерференции обрабатывает ингибирующие РНК для подавления гена-мишени.

Теперь это удивительно! +1. Я попытался отредактировать вопрос. Не могли бы вы проверить, все ли в порядке? Это не совсем моя компетенция.
Вы также можете добавить примечание о переносчиках РНК у C.elegans ( Sid1/2 ). Хотя я не уверен, я предполагаю, что C.elegans (или, возможно, родственные организмы) экспрессируют эти переносчики больше, чем другие известные нам организмы.
@WYSIWYG Илан, и вы дали аналогичный ответ на мой вопрос о c.elegans. Я думаю, что мой вопрос можно объединить с этим. (не могу предоставить ссылку.... через приложение)
Во-первых, клетки кишечника могут поглощать дцРНК, но мы говорим о клетках всего тела у C.elegans! Если мы трансформируем РНК-интерференцию EGFP, это заставит замолчать EGFP всего тела... или нет? Во-вторых, РНК-интерференция производится E.coli или C.elegans? Я не говорю о дцРНК. Если РНКи производится C.elegans, это означает, что C.elegans должен поглощать дцРНК, высвобождаемую из E.coli. Насколько я знаю, дцРНК может быть больше, чем белки... возможно ли напрямую поглощать дцРНК? И также, возвращаясь к первому вопросу, как dsRNA может распространиться на все тело C.elegans, чтобы заставить замолчать большинство клеточных генов во всем теле?
@РоджерЛ. Вы путаете термин РНКи, который представляет собой биологический регуляторный механизм, разрушающий мРНК, с малой дцРНК, которая может запускать путь РНКи. Бактерии синтезируют дцРНК, и она высвобождается, когда бактерии умирают. Клетки C. elegans поглощают или включают те дцРНК, синтезированные бактериями, И содержат транспортеры, которые распространяют дцРНК между соседними клетками. Так что да, EGFP, экспрессируемый в мышцах стенки тела, будет подавляться дцРНК, попадающей в кишечник. Комплекс РНК-интерференции существует во всех клетках червей.
Два гена червя, которые регулируют другие гены червя, используя этот путь, это let-2 и lin-4 . Они не кодируют белки; они кодируют малые интерферирующие РНК, которые связываются со зрелыми мРНК других генов — генов, кодирующих белок. Как только транскрипт lin-4 связывается со своей комплементарной мишенью, дцРНК запускает путь деградации РНКи. Вы также можете вводить дцРНК червям (но это трудоемко) или синтезировать дцРНК in vitro и просто вымачивать в ней животных для достижения того же эффекта, что и кормление их искусственными бактериями.