Могут ли бактерии выделять свободную ДНК в окружающую среду?

Естественная трансформация, также известная как естественная компетентность , включает в себя поглощение ДНК компетентной бактерией (для горизонтального переноса генов или в качестве источника пищи). Мой вопрос о том, откуда может взяться эта внеклеточная ДНК. Обычно эта «свободная» ДНК происходит из лизированных бактериальных клеток. Есть ли случаи, когда ДНК высвобождается без лизиса, который другие бактерии могут поглощать путем естественной трансформации?

Примечание: меня не интересует бактериальная конъюгация , потому что меня особенно интересует внеклеточная ДНК, которая может быть усвоена компетентными бактериями.

Ответы (2)

Естественная трансформация

Процесс естественной трансформации ( Лоренц и Вакернагель, 1994 ) имеет огромное значение в эволюции прокариот. Цитирование определения из ( Stewart and Carlson 1986 )

Естественная трансформация является частью нормальной физиологии клетки. Это единственная форма бактериального генетического обмена, функции которой закодированы в хромосоме, а компетентность является наследственным признаком, подверженным селективному давлению.

Это почти похоже на нашу повседневную искусственную трансформацию . Вам нужно какое-то химическое вещество, например С а С л 2 для пермиабализации клеток некоторые хелатирующие агенты, такие как ЭДТА и материал ДНК. Вы можете представить себе естественную клетку, которая сталкивается с такими условиями, как снижение температуры в присутствии определенных химических веществ и белков.

Эта концепция того, что одна клетка экстернализует ДНК, а другая интернализует ДНК, усилилась, когда исследователи обнаружили свободную ДНК в культуральной среде ( Catlin 1959 , Sinha and Iyer 1971 ).

Создание эДНК

Высвобождение кДНК (внеклеточной ДНК) может происходить посредством спонтанной экскреции или аутолитического действия.

Известны механизмы высвобождения эДНК, подобные образованию пузырьков ( Dorward and Garon 1990 ). На эту внеклеточную продукцию ДНК влияют многие физико-химические факторы, помимо биотических ( Paul and David 1989 ). Есть много подробных отчетов, которые показывают, что такая ДНК может проходить через клеточную стенку без какого-либо повреждения клетки ( Hara and Ueda 1981 ). Период полураспада такой эДНК в различных средах представлен в следующей таблице из ( Lorenz and Wackernagel 1994 ) .

введите описание изображения здесь

Теперь есть еще более новые способы производства внеклеточной ДНК, такие как секреция хромосомной ДНК у Neisseria gonorrhoeae , происходящая через новую систему секреции IV типа ( Hamilton et al 2005 ). Не только эксперименты, математические модели также показывают новую роль такого процесса в отборе на уровне генов ( Draghi and Turner 2006 ). Я не коснулся поглощения этих ДНК, о котором само по себе написано много литературы и уникальных механизмов, подобных этому .

Это именно то, что я искал. Могу ли я также добавить, что в обзоре Chen & Dubnau 2004 года они обсуждают наличие у H.pylori механизма, связанного с системой секреции типа IV для экспорта макромолекул, таких как ДНК.
Верно. Эта статья (Lorenz and Wackernagel 1994) очень хороша. Вы получите все виды ссылок от этого. Удивительно, но я почти не нашел свежих статей по этому поводу (после 2000 года). Терминология изменилась или что?
Когда я впервые «прочитал» статью Лоренца и Вакернагеля (это объемная статья!), я подумал, что в ней в основном обсуждается механизм поглощения, который меня интересовал в то время. При повторном прочтении у него есть целый раздел, посвященный экскреции! Что касается недавних работ, то есть обзор Burton & Dubnau 2010 года , в котором собраны многие из последних исследований. В частности, я заметил белки FtsK/SpoIIIE. Однако это довольно разные системы для всего, что я изучаю.

Хороший вопрос, единственное, что я могу добавить, это то, что в биопленках, хотя ДНК высвобождается посредством лизиса, лизис контролируется с помощью чувства кворума и влияет на определенные субпопуляции (Okshevsky & Meyer, 2013) .

Это странно! Очень интересно, но, к сожалению, не помогает ответить на мой вопрос. В газете может быть некоторая информация, но, к сожалению, она находится за платным доступом!
@GoodGravy Вы можете найти копию статьи здесь .