Как часто происходит бактериальная трансформация?

Я читал:

М. Дрёге, А. Пюлер, В. Сельбичка, «Горизонтальный перенос генов среди бактерий в наземных и водных средах обитания по оценке микрокосма и полевых исследований», Biol. Плодородный. Почвы (1999) 29 стр. 221–245 [PDF]

Я не биолог и пытаюсь понять, как часто прокариоты вносят изменения в свою хромосомную ДНК.

Как часто плазмидная ДНК успешно встраивается в хромосомную ДНК?

Я хотел бы оценить либо количество генных изменений (или, в противном случае, изменений пар оснований), которые бактерия производит в единицу времени. Или, что то же самое, среднее время между такими изменениями.

Ответы (1)

Трансформация лежит в основе многих лабораторных современных проектов.

Это будет очень неудовлетворительный ответ, и эта запись в Википедии объясняет, почему. Время и успех бактериальной трансформации компетентных клеток сильно различаются в основном в зависимости от нескольких факторов:

  • длина последовательности нуклеиновой кислоты для вставки (или, точнее, плазмиды)
  • вид целевого организма (или, точнее, генотип целевого организма)
  • множество других вещей

С конкретной плазмидой и организмом вы могли бы получить более удовлетворительный ответ, но я полагаю, что ответ даже будет отличаться от лаборатории к лаборатории.

Я работал с микробиологом, который снабдил меня белком в рамках моего проекта с отличием, и я могу поделиться с вами общим впечатлением, которое я получил от них: это случается нечасто. Иногда ни одна из культур, которые вы пытаетесь трансформировать, не включит новую последовательность в свой геном, в других случаях процесс клонирования проходит очень хорошо, и все ваши культуры будут успешно трансформированы. Для нашего проекта действительные колонии были представлены только через неделю с разумным успехом (более половины попыток были успешными). Но вы не знаете, сработало ли преобразование, пока не произошло первое преобразование.

Механизмы, лежащие в основе этого, недостаточно изучены. Если мы возьмем что-то вроде B. subtilis , пожалуй, наиболее академически изученного организма в области трансформации, он может использовать ДНК в качестве пищи или включать ее в свой геном, но никто точно не знает, как это происходит на молекулярном уровне (Chen & Dubnau). , 2004)

Чен, И., и Дубнау, Д. (2004). Поглощение ДНК во время бактериальной трансформации. Обзоры природы. Микробиология, 2 (3), 241–9.

Спасибо, это фантастика! Я имею в виду, что это не удовлетворительный ответ, как вы говорите, но приятно услышать от кого-то, кто имеет некоторую квалификацию в этой области. У меня тоже сложилось впечатление, что эти вещи были в значительной степени дублерами. Еще раз большое спасибо!
Как часто происходит бактериальная трансформация?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v