Какое событие приведет к тому, что нынешняя Митохондриальная Ева будет заменена новой?

По-видимому, все живущие люди являются потомками по материнской линии одной женщины, жившей 200 000 лет назад. Ее зовут Митохондриальная Ева.

Но в то время, когда она жила, был другой предок по материнской линии, общий для всех живущих людей. И между тем и сейчас, я полагаю, многие другие женщины были Митохондриальными Евами человеческой популяции, жившей в определенное время.

Мне интересно, какие события заставят другого, более позднего матрилинейного предка стать Митохондриальной Евой всех живых людей?

Один из сценариев, который я могу себе представить, заключается в том, что человеческая популяция находится на грани исчезновения, и выживает буквально несколько человек. Поскольку в живых осталось так мало людей, я полагаю, что вероятность того, что у них есть более поздний матрилинейный предок, высока.

Возможны ли другие сценарии? Уменьшается ли вероятность появления новой Митохондриальной Евы, если человеческое население велико (миллиарды), а не мало (сотни или тысячи)? Предположим, что человеческая популяция не уменьшится, возможно ли, что будущие человеческие популяции когда-либо будут иметь другую митохондриальную Еву, чем нынешняя популяция? Зависит ли это от количества мигрирующих людей?

Те же вопросы можно задать для Y-хромосомного Адама и самого последнего общего предка всех людей, я полагаю...

Математическим решением этого вопроса является процесс Гальтона-Ватсона. Она сформулирована в терминах фамилий, и эта ситуация очень похожа. en.wikipedia.org/wiki/Galton%2DWatson_process
Похоже, что генетического Адама только что заменили... так что вот. newscientist.com/article/…

Ответы (3)

Один из возможных сценариев может состоять в том, что у конкретной женщины развивается мутация, делающая ее гораздо более «подходящей» (в эволюционном смысле), чем ее сверстницы. В качестве аргумента давайте возьмем очень упрощенный случай рецессивной мутации, сцепленной с Х-хромосомой, из-за которой у женщин, которые ее вынашивают, рождается, скажем, 10 детей при каждом рождении. Если эту мутацию затем передать потомству, она очень быстро распространится по всей популяции.

Если это продолжится в течение нескольких поколений, подавляющее большинство населения земли будет потомками той единственной женщины, которая несла первоначальную мутацию, она станет новой митохондриальной Евой.

Я хочу подчеркнуть, что это не что иное, как очень упрощенный мысленный эксперимент. Такая мутация i) очень маловероятна, вероятно, невозможна, ii) вероятно, сделает носящего ребенка менее приспособленным, чем более, поскольку каждое рождение будет утомительным, увеличивая шансы умереть во время родов.


Обновлять:

Я указал, что мутация должна быть Х-сцепленной и рецессивной. Это означает, что он будет иметь фенотип только у гомозиготных по нему женщин, у которых оба родителя несут мутацию. Это потому, что, как очень правильно указал mgkrebbs в комментариях ниже, в противном случае ее сыновья спаривались бы с женщинами, которые не являются их сестрами, и у их детей была бы мутация, но не ее мДНК. Если фенотип проявляется только тогда, когда мутация является гомозиготной, только женщины, чья мать является носителем мутации (и мДНК Евы), будут проявлять ее, и только тогда возникнет новая мутация.

Неверно, поскольку такая мутация в значительной степени должна быть в ядерном геноме, а не в митохондриальном геноме. Находясь на ядерной хромосоме, она передавалась бы потомству женщин, не являющихся ее митохондриальными потомками, и, таким образом, она не стала бы митохондриальной канвой.
@mgkrebbs, да? Конечно, мутация будет в ядерном геноме и, конечно же, по определению она передастся только ее потомкам. Что такое митохондриальные потомки? Каждая женская яйцеклетка содержит как митохондрии, так и геном родителя. Да, мутация не будет перенесена ее митохондриями, однако ее митохондрии будут перенесены ее потомками, следовательно, она будет новой митохондриальной Евой (хотя, как указывает Шигета, она все равно будет потомком нашей самой МЭвы) .
Но эти мутации в конечном итоге также могут быть переданы потомству через потомков по отцовской линии, верно? Какой фактор повышает вероятность того, что эта женщина станет М-Ев? Неужели наша М-Ева так сильно отличалась от других женщин, живших в то время?
@molf, не обязательно нет. Дело в том, что митохондрии происходят от матери, а не от отца. Следовательно, если одна самка имеет гораздо больший репродуктивный успех, чем ее сверстники, и потомство этой самки также делает то же самое, в конечном итоге ВСЕ особи будут потомками этой одной самки. Поскольку митохондрии происходят исключительно от матери, все люди будут иметь один и тот же митохондриальный геном. Их ядерный геном будет другим, так как на него также влияет отец, но это не имеет отношения к обсуждаемому вопросу.
Это верно, но не обязательно, чтобы одна женщина обладала гораздо большей физической подготовкой. Даже если бы приспособленность была одинаковой, дрейф произвел бы митохондриальный канун с достаточным временем. Точно так же один игрок получит все деньги, если игра в покер будет продолжаться достаточно долго, даже если они будут равными игроками.
@DQdlM, я не уверен ... Дрейф повлияет на распространение генов в популяции. Я не вижу причин, по которым это должно повлиять на MEve.
Вот как я это вижу: если в популяции есть 10 М линий на одинаковой частоте. и фитнес. В каждом поколении линии будут увековечены в зависимости от их частоты. Без дрейфа частоты. не изменится, и ни одна линия не исчезнет, ​​но дрейф может повышать или понижать частоту. линии случайно, поэтому со временем некоторые линии станут менее частыми и более уязвимыми к исчезновению, а другие станут более частыми и менее уязвимыми к исчезновению. При достаточном количестве времени останется только одна линия. Это МЭВ.
@DQdlM, хорошо, да, я понимаю твою точку зрения. Однако я все еще не уверен, применим ли здесь дрейф. Даже если М-линии имеют одинаковую частоту. и пригодности, ядерных геномов хозяев не будет. Следовательно, приспособленность ядерного генотипа будет влиять на распространение М-линий гораздо больше, чем дрейф. Единственный способ, которым я могу представить дрейф митохондриального генома, создающий новый MEve, — это если бы и ядерный, и митохондриальный геномы были свободны от какого-либо селективного давления и управлялись бы только дрейфом.
Согласовано. В природе и отбор, и дрейф будут действовать согласованно, и их будет очень трудно разделить. Однако мое понимание концепции MEve заключается в том, что оценка основана на накоплении нейтральных мутаций в мито. ДНК, поэтому <em>оценка</em> предполагает отсутствие отбора и только дрейф. Выбор должен ускорить процесс, а MEve будет более поздним (при условии, что он не меняет направление во время процесса) - как вы указываете в своем ответе.
@terdon, поскольку вы говорите: «Конечно, мутация будет в ядерном геноме», сценарий вряд ли сделает конкретную женщину митохондриальной Евой. Предположим, что у нее 5 сыновей и 5 дочерей, тогда потомки 5 сыновей с такой же вероятностью будут нести полезную ядерную мутацию и, следовательно, иметь выживших потомков, но дети сыновей не несут ее мДНК. Население не будет особенно благосклонно относиться к потомкам исходной женщины, состоящим только из женщин, следовательно, не одобрит ее митохондрии и не одобрит ее превращение в М-Еву.
@mgkrebbs, я понимаю, что вы имеете в виду, однако, даже если мутация передается ее потомству мужского пола, это не имеет значения. Поскольку самки каждого поколения, несущие мутацию, будут постоянно иметь больше потомства, в конечном итоге подавляющее большинство видов будут нести мутацию. Следовательно, ее потомки мужского пола будут спариваться с ее потомками женского пола, тем самым распространяя ее мДНК.
@terdon, да, «самки каждого поколения, несущие мутацию, будут постоянно иметь больше потомства, в конечном итоге подавляющее большинство видов будут нести мутацию» верно, но неверно , что этим самкам нужна ее мДНК. Ее сыновья спаривались с не сестрами, поэтому все их потомки, сыновья и дочери, не будут иметь ее мДНК, но в той же степени будут иметь полезную мутацию .
@mgkrebbs, теперь я понимаю, ты абсолютно прав. Я изменил свой ответ, чтобы сделать гипотетическую мутацию, сцепленную с Х-хромосомой, рецессивной.
Это увеличило бы вероятность того, что она могла бы стать М-Ев, но не гарантирует этого. Во-первых, будучи рецессивными, ни один из детей женщины, несущих мутацию, не будет иметь никаких преимуществ, поскольку они будут спариваться с не носителями и, таким образом, не проявят преимущества. (Предположим для обсуждения, что оба ее X имеют мутацию.) Теперь обратите внимание, что из ее внуков половина из них будет носителями, а половина — нет. Обратите также внимание, что все дочери сыновей будут носителями (X исходит от нее), в то время как [продолжение в следующем комментарии]
...при этом только половина дочерей дочери будет носителями (плюс половина сыновей дочери). Это означает, что наиболее вероятное первое появление преимущества в фертильности происходит между двоюродными братьями: сыном дочери и дочерью ребенка любого пола от исходных женщин (за исключением маловероятных спариваний брата и сестры). Две трети этих последних внучек (вероятностно) произошли от сыновей; другая треть через дочерей. Таким образом, 2/3 не будут нести исходную мДНК, и, таким образом, исходная женщина вряд ли станет М-Евой.
Какой более реалистичный сценарий может позволить выжить только одной линии?

Новая митохондриальная Ева жива прямо сейчас.

Когда люди размножаются, матери передают свои митохондрии своим потомкам без участия отца. В результате каждый человек может проследить свою митохондриальную родословную как неразрывную цепь до одной отдельной женщины в прошлом. В силу случайного случая (генетический дрейф) или естественного отбора женщины в одних митохондриальных линиях передают потомство следующему поколению, а в других нет. Если женщине не удается передать потомство следующему поколению, то она представляет собой конец (то есть исчезновение) конкретной митохондриальной линии. С течением времени все больше и больше первоначальных митохондриальных линий будут вымирать, пока все люди не будут представлять одну оставшуюся линию.

Обратите внимание, что это непрерывный процесс, поскольку линии накапливают различия за счет мутации митохондриальной ДНК. Эта мутация является источником различных родословных, которые будут развиваться дальше. Основываясь на предполагаемой скорости мутации митохондриальной ДНК, мы можем оценить, сколько времени потребуется существующим митохондриям, чтобы развить генетические различия, которые мы сейчас наблюдаем.

Если вы сделаете снимок этого процесса в какой-то момент времени (например, современные люди), вы можете использовать это предполагаемое время, чтобы сказать, сколько времени потребуется для накопления нынешних различий — то есть, когда линия началась. Из-за постоянного вымирания существующих митохондриальных линий в будущем существует некоторый момент, когда, если бы мы сделали снимок, мы бы оценили, что митохондриальная ночь жива прямо сейчас.

РЕДАКТИРОВАТЬ на основе комментария:

Скорость формирования новой митохондриальной канвы основана на накоплении мутаций в некодирующих областях митохондриальной ДНК (т.е. молекулярных часах), которая зависит от размера популяции только в той мере, в какой вероятность того, что данная митохондриальная линия выживет, когда все остальные вымрут, в основном это ее начальная частота в популяции. Таким образом, в большой популяции с большим начальным разнообразием каждая линия будет иметь меньшую вероятность успеха.

Кроме того, если нет отбора за или против данной линии, то изменения в частоте обусловлены случайностью (генетический дрейф). В большой популяции эффект дрейфа меньше, чем в небольшой популяции. Таким образом, если размер популяции невелик, то вероятность того, что митохондриальная линия вымрет, выше, а вероятность того, что одна митохондриальная линия станет митохондриальным каналом, выше.

Правда, я не продумал это до конца ... Я отредактировал свой ответ, чтобы удалить ссылки на видообразование.
Это звучит справедливо, но мне остается только гадать, зависит ли скорость вымирания митохондриальных линий от общей популяции. С какой скоростью люди получают новую М-Еву и какие факторы влияют на эту скорость?
@molf Я отредактировал свой ответ, чтобы ответить на ваш комментарий. Надеюсь, это поможет.
похоже, вы ожидаете, что все митохондриальные линии исчезнут в будущем. почему это произошло? Такого никогда не было в прошлом.
@shigeta это случалось в прошлом. Митохондриальные линии постоянно вымирают, но благодаря мутациям возникает новое разнообразие. Используя скорость нейтральных мутаций, мы можем оценить, сколько времени потребовалось популяции, чтобы накопить такое количество разнообразия, т. е. время, прошедшее с момента, когда это разнообразие стало равным нулю, т. .
вопрос в том, что должно произойти, прежде чем митохондриальная Ева будет заменена. на планете 7 миллиардов человек. Вы правы, это могло произойти до нашей нынешней Евы, но вы действительно верите, что это произойдет когда-нибудь в будущем?
Митохондриальный канун после того, который у нас есть сейчас, вероятно, сейчас не жив. Если вид существует достаточно долго, кто-то, родившийся сегодня, может стать новой Евой, а может и нет. Представьте себе убийство всех женщин в мире, кроме двух индейских женщин. Это отодвигает митохондриальный канун примерно на 15 тысяч лет назад, «пропуская» 185 тысяч лет истории. Точно так же нас могут «пропустить».

Что должно произойти, чтобы митохондриальный геном одной женщины оказался у всех живых людей?

Все остальные женщины должны были бы внезапно или постепенно быть исключены из генофонда. Ни одна другая женщина не могла войти в генофонд этого будущего человечества. Таким образом, наиболее вероятным сценарием является тот, в котором в какой-то момент нам придется свести нас к одинокой женщине.

Была поднята генетическая изоляция, но слова «все живые люди» на самом деле не означают «изоляцию». В изоляции есть другие люди, которые продолжают заниматься чем-то другим. Здесь речь идет только об изоляции в том смысле, что размножаться остаются только заводчики.

Даже в этом случае любая человеческая женщина все равно будет потомком MEve. Та первоначальная Ева по-прежнему была бы митохондриальной Евой, хотя геномная запись, указывающая на нее, исчезла бы.

Совершенно Новая Ева могла бы произойти, если бы появилась женщина, не имеющая отношения к МЭве , и ее потомство было бы настолько более успешным, чем все другие женщины, что со временем только дочери этой женщины были выбраны в качестве матерей. Она была бы невероятно успешной, поскольку все ее дети были ростом 6 футов 6 дюймов и были намного умнее, привлекательнее и т. д., тогда остальная часть генофонда могла бы сократиться, оставив только «новую Еву». Это могло бы произойти, скажем, если бы у нас появились неандертальцы. Хотя, похоже, они вряд ли возьмут верх .

Это похоже на сценарий, когда одна женская линия просто превосходит все другие женские линии, чтобы принять мантию М-Евы. Мне это кажется менее вероятным. Эта родословная должна иметь преимущество, которое должно перевешивать все варианты, существующие в то время и когда-либо возникавшие в следующих поколениях, прежде чем наша новая М-Ева окончательно доминирует. Учитывая количество генов и возможных вариантов во всем геноме, это статистически маловероятно.

Что касается нового Y Адама , то подобное едва не случилось с мужчинами. Напомним, что Y-хромосома передается исключительно от отца к сыну, поэтому Y-Адам будет единственным предком всех мужчин на планете.

Исследование геномов, спонсируемое National Geographic, показало, что в Центральной Азии 8% всех мужчин имеют одинаковую Y-хромосому . Во всем человечестве 0,5% всех мужчин имеют одинаковую Y-хромосому . Генетика указывает на монгольского царя-воина Чингисхана, чьи походы через Азию к порогу Европы включали в себя то, что он каждую ночь спал с одной или несколькими женщинами из покоренных народов, одна из которых, как считается, убила его . Не случайно он также убил многих мужчин, что устранило большую конкуренцию за его потомство в будущем.

Тем не менее, все это лишь малая часть того эффекта, о котором вы говорите. Трудно представить себе 100% замену потомками одного человека в сценарии, меньшем, чем вымирание. Или новая раса сверхсуществ, произошедшая от одного человека. Трудно представить, учитывая, что сейчас на планете миллиарды людей.

Это немного легче представить в случае с новым Адамом только потому, что у одного человека могут быть сотни или даже тысячи потомков за его жизнь. Даже в этом случае мужская психология , кажется, поднимает этот вопрос более чем рационально . Это все еще крайне маловероятно (не произойдет).

введите описание изображения здесь

Также стоит отметить, что немногие виды смогли вернуться из такого небольшого генофонда и численности ...

Вот дерево Y-хромосом человека. Вы можете видеть ту толстую серую кляксу, которая является потомком GK.введите описание изображения здесь

Основываясь на комментарии к моему ответу, я удалил упоминание об изоляции, поэтому я отредактировал вашу ссылку на часть моего ответа, которой больше не существует.
Я также редактировал - я думаю, что пробежался по вашим изменениям, но я убрал ссылку на вас.
Это представление, кажется, противоречит гипотезе о том, что наша нынешняя М-Ева не была единственной живой женщиной в то время. Не так ли и у других современниц нашей М-Евы есть живые потомки, только не по материнской линии?
Если бы существовала группа женщин, совершенно не связанных родственными узами во время возникновения человеческого рода, мы должны были бы увидеть ее в митохондриальном варианте приведенной выше схемы — более одного дерева. Кажется, что человеческая раса (и видообразование) началась всего с одного события. С другой стороны, интересно, что существуют теории о том, что неандертальцы и денисовцы спаривались с людьми после того, как покинули Африку, но, похоже, здесь это не проявляется. en.wikipedia.org/wiki/…
Не требуется, чтобы все другие женщины были исключены из генофонда, а скорее, чтобы со временем отдельные линии митохондриальной ДНК (основанные на некоторых первоначальных вариациях в определенное время в прошлом) вымерли.
Как сделать так, чтобы одна хромосома вымерла, а остальные хромосомы размножались?
Дело в том, что вам ни в коем случае не нужно сводиться к одной женщине. Если прямо сейчас существует x различных митохондриальных линий. Со временем доля потомков каждой из этих линий будет меняться (n/x), а некоторые линии вымрут (0/x). По прошествии достаточного количества времени все линии, кроме одной, вымрут (либо в результате отбора, либо в результате дрейфа), и все особи в популяции будут потомками одной линии. Обратите внимание, что фоновая мутация будет означать, что существующая вариация не обязательно будет уменьшаться со временем.
Это правда, хотя на самом деле я не имел в виду, что всех женщин нужно будет убрать одновременно, но в конце концов им придется выйти, чтобы реализовать описанный сценарий. Я думаю, что это то, что я сказал, хотя это правда не в верхней части записи. Этот параллельный конкурентный MEve гораздо менее вероятен. Я могу изменить свой ответ, чтобы описать, насколько это маловероятно, хотя все эти сценарии - материал научной фантастики - больше мыслительных упражнений, чем вообще может произойти.
Я действительно не думаю, что это научная фантастика, а способ думать о генетическом дрейфе. По сути, это просто генетический дрейф в обратном направлении. MEve — это всего лишь оценка того, сколько времени потребовалось дрейфу, чтобы уничтожить генетическое разнообразие популяции.