Я посетил семинар по нейрогенезу, на котором были представлены результаты для PAX6 как важного TF, который содержит 3 домена с очень разными паттернами нижестоящей экспрессии. Докладчик закончил тем, что сказал, что PAX6 можно рассматривать как 3 ТФ в одном белке, действующие независимо в разных ситуациях:
Относительная роль различных доменов Pax6 в развитии альфа-клеток поджелудочной железы
Кто-нибудь знает больше таких примеров?
Семейство факторов транскрипции NF-κB очень модульное, разные комбинации имеют разные эффекты. Активный (ядерный, связанный с ДНК) TF представляет собой димер, состоящий по-разному из субъединиц RelA/p65 , RelB , c-rel , NFKB1/p50 и/или NFKB2/p52 . Например, «канонический» димер p65/p50 активируется в ответ на такие стимуляторы, как TNF-α (фактор некроза опухоли альфа, высвобождаемый в ответ на воспалительные сигналы, такие как присутствие патогенов) и LPS (липополисахарид из клеточных стенок грамположительных клеток). отрицательные бактерии), в то время как димер RelB/p52 играет важную роль в развитии В-клеток .(компонент иммунной системы, который вырабатывает антитела). Транскрипционный фактор AP-1 также является гетеродимерным, содержащим белки из семейств Jun, Fos, JDP и ATF, и существует множество других примеров мультимерных комплексов транскрипционных факторов. Эта недавняя статья в Nature Immunology (отказ от ответственности: я не участвовал в этом исследовании, но моя старая лаборатория проделала аналогичную работу) показывает специфичное для последовательности ДНК связывание различных димеров NF-κB.
Полимерия в целом и димерия в частности — довольно распространенные способы активации и регуляции транскрипции. Большое количество способов комбинирования относительно небольшого числа транскрипционных факторов позволяет точно контролировать гены, реагируя на огромное разнообразие клеточных ситуаций. К сожалению, это также означает, что мутации в ключевых общих компонентах могут привести к трансформации, неограниченному росту и образованию опухолей.
В прошлом году в журнале Cell была опубликована статья, в которой показано, что мотив связывания фактора транскрипции Hox будет меняться в зависимости от того, связан ли с Hox кофактор.
Слэттери и др. (2011) Связывание кофактора вызывает скрытые различия в специфичности связывания ДНК между Hox-белками . Сотовый , 147 (6) 1270-1282. doi: 10.1016/j.cell.2011.10.053 ( pdf )
Люк