Плюсы и минусы структуры аминокислот по сравнению с последовательностями ДНК для эволюционного сравнения [закрыто]

Это аналитический вопрос для лаборатории о различиях аминокислот в бета-глобине у разных приматов и использовании таких различий для построения кладограммы и вывода на ее основе эволюционных отношений. Любой вклад приветствуется!

Вопрос: В чем вы видите сильные и слабые стороны использования аминокислотной структуры белков для эволюционного анализа? По вашему мнению, было бы полезнее использовать последовательности ДНК для такого типа эволюционного сравнения между живыми и существующими видами? Почему или почему нет?

Поскольку это домашнее задание/курсовая работа, от вас обычно ожидают, что вы сначала продемонстрируете свои усилия. Но, чтобы дать вам подсказку, настоящий ключ находится в избыточности аминокислотной последовательности.

Ответы (1)

Аминокислотная (белковая) структура имеет свои преимущества перед необработанной ДНК.

В структуре белка уже вырезаны интроны (некодирующие области), которые не очевидны из простой цепочки ДНК.

Белок может иметь различную форму (например, несвязанный/связанный) или даже свернутый/неправильно свернутый (как в случае прионов). ДНК не может кодировать эти изменения, поскольку они зависят от субстратов, факторов окружающей среды и доступной энергии.

Визуализация трехмерной структуры белка может дать представление о его функциональности, которую вы не можете прочесть по цепочке ДНК.

Но в контексте этого вопроса мы хотим использовать последовательность ДНК или аминокислот для построения чего-то вроде филогенетического дерева. Я не специалист в области филогенетики, но полагаю, что важная информация содержится в этих интронах, потому что у них обычно больше свободы для мутаций, чем у экзонов. Таким образом, у двух видов может быть белок с одинаковой последовательностью аминокислот, но с разными последовательностями ДНК в интронах. Вы можете использовать эти различия, чтобы определить, как они связаны.
Плюсы и минусы структуры аминокислот по сравнению с последовательностями ДНК для эволюционного сравнения [закрыто]
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v