Почему в элементах ответа есть инвертированные повторы?

На следующем рисунке показана инвертированная последовательность повторов в элементе ответа. Последовательности элементов ответа для глюкокортикоидов, эстрогена и гормона щитовидной железы показывают, что все они содержат обратные повторы. Почему эти перевернутые повторы существуют во многих ответных последовательностях? Другими словами, какое преимущество они представляют для функции ответного элемента?введите описание изображения здесь

Ответы (1)

Начиная с прокариотических (т.е. бактериальных) факторов транскрипции, которые были первыми подробно охарактеризованными, был отмечен этот тип паттерна. Даже «классические» эндонуклеазы рестрикции типа II, используемые для молекулярного клонирования, имеют палиндромные последовательности распознавания. Во всех трех случаях ответ заключается в том, что специфичный для последовательности ДНК-связывающий белок связывается как димер, и поэтому каждый мономер распознает «полусайт» (одну из перевернутых последовательностей).

Спасибо за Ваш ответ. Мы поощряем ссылки на внешние источники для поддержки утверждений в ответах. Таким образом, плакат или заинтересованные читатели могут проверить, верны ли они, и узнать больше о теме, чем может быть уместно включить в ответ. Вы можете отредактировать свой ответ в любое время.
@RosieF В таком случае важно ли инвертировать повторяющиеся последовательности? Разве ДНК-связывающие белки не могли бы по-прежнему связываться в виде димера, если бы это была просто последовательность, повторяющаяся без инверсии?
Я думаю, что наиболее важной концепцией здесь является то, что наличие нескольких сайтов связывания, сосредоточенных в небольшой области, эффективно увеличивает концентрацию фактора транскрипции. Чем больше сайтов, тем больше специфичность и, следовательно, возможна большая биологическая регуляция (например, ON или OFF). Расположение интерфейса димеризации на мономере изменится, если сайты узнавания будут прямыми повторами, а не инвертированными повторами. Вероятно, есть (?) примеры того и другого. Конечно, первые охарактеризованные были инвертированы.
Почему в элементах ответа есть инвертированные повторы?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v