Системная биология и эволюция: Книги-рекомендации

У меня относительно хорошие знания в области эволюционной биологии и популяционной генетики. Меня все больше и больше интересует эволюция...

  • генетические процессы развития
  • взаимодействие генов
  • экспрессия генов
  • пластичность
  • собственный или клеточный шум
  • мутационная устойчивость

Кажется, меня все больше интересует область, которая находится между популяционной генетикой и системной биологией . Я очень мало знаю о системной биологии.

Не могли бы вы порекомендовать мне книги (и другую литературу, например обзоры), в которых рассказывается об эволюции тех процессов, которые обычно изучаются системными биологами? Меня гораздо больше интересует книга, в которой представлены концепции и методы, чем книга, содержащая эмпирические наблюдения. Кроме того, меня интересует не медицина, а биология.

Системная биология кажется настолько новой, что я ожидаю, что большинство книг по этой теме, вероятно, будут сборниками статей с симпозиумов. Учитывая ваш подробный список, первым автором, который приходит на ум, является Стюарт А. Кауфманн (в его имени может быть еще одна буква «f»). Недавно я видел, как кто-то здесь цитировал свою книгу 1993 года «Происхождение порядка». Он настоящий биолог-теоретик, как Фрэнсис Крик. Он был связан как с Медицинской школой Пенна, так и с аналитическим центром Института Санта-Фе.
Боюсь, что нет ни одной книги, которая бы освещала эти темы. В « Введении в системную биологию » Ури Алона мало говорится об эволюции генных сетей; в основном речь идет о сетевых мотивах и их динамическом поведении. Вы можете ознакомиться с работами Барабаси по эволюции регуляторных сетей генов ( эта книга-глава на самом деле не о GRN, но может быть полезна, поскольку в ней говорится о приспособленности сетевых узлов).
@mdperry Я недавно цитировал эту книгу. (Есть лишняя буква «f» и на одну букву «n» меньше ;P ). Это хорошо, хотя я не продвинулся дальше первых нескольких глав.
Я ее не читал, но эта книга показалась мне интересной: Эволюционная системная биология .
@falsum да, это выглядит очень хорошо, и это совсем недавно. Хотя книга дорогая, но я только что обнаружил, что у меня есть доступ к онлайн-версии через мой университет. Довольно удобно. спасибо

Ответы (1)

Вот парочка, которой я владею:

«Классика» от Ури Алона затрагивает многие из упомянутых вами тем. Он легко читается и относительно глубоко описывает методы. Кажется, есть новое издание (если поискать его на Amazon, оно всплывет), но оно было запланировано на апрель прошлого года, а затем было отложено, поэтому неясно, когда оно будет фактически опубликовано. Для оригинала: ссылка на Amazon

Title: An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits
Year: 2006
Author: Uri Alon
Publisher: Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology

Другая книга — это учебник «Системная биология» Эдды Клипп и других. Два года назад я присутствовал на выступлении Эдды Клипп, и, похоже, она занимается интересными вещами. Эта книга носит более общий характер и затрагивает, хотя и несколько поверхностно, многие темы. Это может быть хорошо, чтобы получить общее представление о поле. Ссылка на Амазон.

Title: Systems Biology Paperback
Year: 2009
Author: Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald, Hans Lehrach, Ralf Herwig
Publisher: Wiley-Blackwell

Есть много других (см. результаты Amazon здесь ). Возможно, другие участники могут прокомментировать некоторые другие названия.

Похоже, книга Алона подойдет. Спасибо за эту замечательную рекомендацию. +1 Подожду, будет ли другое мнение, и тогда, наверное, возьму книгу Алона.
Конечно, подождем другого мнения. Есть много книг, и я не уверен, что взял лучшие! Я также хотел бы знать о других хороших книгах.
Системная биология и эволюция: Книги-рекомендации
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v