Могут ли фотоны, генерируемые многими триллионами звезд, вносить свой вклад в темную энергию? Куда они делись и что с ними стало?

Нет, не может. См. раздел технических определений в статье о темной энергии в Википедии.

В стандартной космологии есть три компонента Вселенной: материя, излучение и темная энергия. Материя — это все, чья плотность энергии пропорциональна обратному кубу масштабного коэффициента, т. е.$\rho \propto a^{−3}$, в то время как излучение - это все, что масштабируется до четвертой степени, обратной масштабному коэффициенту ($\rho \propto a^{−4}$). Это можно понять интуитивно: для обычной частицы в кубическом ящике удвоение длины ребра ящика уменьшает плотность (и, следовательно, плотность энергии) в восемь раз ($2^3$). Для излучения уменьшение плотности энергии больше, потому что увеличение пространственного расстояния также вызывает красное смещение.

Последний компонент — темная энергия; «темная энергия» - это все, что по своему действию является внутренним свойством пространства: имеет постоянную плотность энергии, независимо от размеров рассматриваемого объема ($\rho \propto a^{0}$). Таким образом, в отличие от обычной материи, она не разбавляется расширением пространства.

Фотоны — это излучение: плотность их энергии уменьшается по мере расширения Вселенной, а также возникает красное смещение. Они принципиально отличаются от темной энергии. Следовательно, невозможно, чтобы фотоны, генерируемые звездами, вносили свой вклад в темную энергию.

Фотоны не темные, они светлые. Проще говоря, фотоны, которые не достигают наших инструментов, являются темными, но очень маловероятно, чтобы огромное количество темной энергии частично состояло из огромного количества фотонов, которые случайно летят в неправильном направлении.

Остальные вопросы задавайте в отдельных постах.