Агароза против агара? Почему гели ДНК используют только агарозу и как получить агарозу из агара?

Агар — относительно дешевое вещество из красных водорослей. И он содержит сахаридную агарозу, а также небольшое количество пектина.

Агар используется для культуральных планшетов как есть, но для гелей ДНК используется сорт агарозы, я полагаю, с удаленным пектиновым веществом. Что происходит, когда гель работает в агаре? т.е. зачем удалять пектин?

Если вы можете догадаться, как удаляется пектин? Я знаю, что есть ферменты , которые могут это сделать, но не уверен, что они действительно используются.

@dd3 дал отличный ответ - особенно с цифрами в ответе! Хотелось бы увидеть ответ на вопрос, на что похож промышленный процесс.

Ответы (2)

Ответ на первую часть вашего вопроса можно найти в Википедии :

Агар представляет собой гетерогенную смесь двух классов полисахаридов: агаропектина и агарозы. Хотя оба класса полисахаридов имеют одну и ту же основу на основе галактозы, агаропектин сильно модифицирован кислотными боковыми группами, такими как сульфат и пируват. Нейтральный заряд и меньшая степень химической сложности агарозы делают ее менее вероятной для взаимодействия с биомолекулами, в связи с чем агароза стала предпочтительной матрицей для работы с белками и нуклеиновыми кислотами.

На этой странице сравниваются результаты использования агаровых гелей и агарозы:введите описание изображения здесь

Вторая часть вашего вопроса: вот вам патент , хотя я понятия не имею, распространен ли этот метод очистки агарозы. Очистка агарозы пропиленгликолем, кажется, часто всплывает. Я думаю, что люди, которые очищают свою собственную агарозу, используют этот метод, но я не уверен, что у биотехнологических компаний есть другие методы.

РЕДАКТИРОВАТЬ: обычно используется пропиленгликоль, за которым следует этиленгликоль, но ПЭГ использовался по крайней мере один раз .

спасибо за этот ответ! Я просмотрел аналогичные патенты после того, как посмотрел тот, на который вы указываете, и еще в 1987 году они осаждали агарозу гликолями или ПЭГ ... выглядит хорошо!
Пожалуйста. Это был хороший вопрос, и мне было приятно найти на него ответ.

Используя ДМСО (диметилсульфоксид), можно разделить агарозу. После нагревания и перемешивания около 2 часов вы получите желтый жесткий гель агарозы путем фильтрации.

это здорово! есть рецепт? Я хотел бы попробовать это!
@shigeta: вот бумага
Агароза против агара? Почему гели ДНК используют только агарозу и как получить агарозу из агара?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v