Чем различаются генетическая кластеризация и резкость Клайна?

Кластеризация и Clines — это два принципиально разных подхода к решению проблем структуры населения. Поскольку многие результаты классической популяционной генетики получены из панмиктической популяции, естественно распространить их на несколько панмиктических популяций с некоторой степенью потока генов между ними, например, модель острова Райта и модель ступенчатого камня Кимуры. В этих дискретных моделях мы рассматриваем каждую субпопуляцию как племенную группу, и, следовательно, алгоритм кластеризации можно использовать для большого количества людей, чтобы классифицировать их на основе того, к какой субпопуляции они принадлежат. Это на 100% верно, если реальное население на самом деле дискретно (например, на Галапагосских островах), но не так, если реальное население распределено в пространстве непрерывно. В последнем сценарии

Вы можете проверить статьи Монтгомери Слаткина и Ника Бартона по теории клинов еще в 1970-х и 1980-х годах, чтобы получить подробности, но общее свойство клинов состоит в том, что если расходящийся отбор является основной причиной клинов, то крутизна клинов пропорциональна крутизне клинов. селекционные различия, но существует характерный пространственный масштаб изменчивости$\sigma/\sqrt{s}$, ниже которого любая пространственная структура, вероятно, будет затоплена рассеянием ($\sigma$- среднее расстояние рассеивания особи, а$s$— интенсивность отбора). Таким образом, даже если клин представляет собой ступенчатую функцию, что совсем нереалистично, клин по-прежнему будет иметь конечную крутизну. Пока$\sigma$отличен от нуля, вы не получите четкой границы между двумя сторонами населения, тем самым аннулируя предположение об алгоритме кластеризации. Однако, хотя кластеризация не очень точна в непрерывной популяции, мы все же можем использовать ее для качественного исследования наших генетических данных и структуры популяции, на самом деле многие люди предпочитают использовать ее, потому что она концептуально ясна и ею легко манипулировать на компьютере. .