Наш учитель поручил нам сделать проект с чрезвычайно открытым подсказкой, и он должен быть завершен в течение месяца. Я планировал сделать что-то, связанное с вычислениями и эволюцией с точки зрения биологии, хотя я не совсем уверен, с чего начать. Я говорю просто, потому что я не профессиональный программист, скорее, меня очень интересует эта область, и я надеюсь использовать это как возможность расширить свои навыки. Буду очень признателен за любые идеи по проекту или с чего начать.
Вы можете использовать ресурсы BLAST или NCBI для анализа чего-то вроде дублирования гена в вирусе ВИЧ, например. Если вы ищете, с чего начать, я бы порекомендовал просто изучить ресурсы базы данных NCBI.
В дополнение к тому, что предложило Ham Radio, проверка Galaxy может быть неплохой идеей для выполнения любых вычислений/анализа, которые в противном случае пришлось бы выполнять в командной строке. В частности, ознакомьтесь с инструментами для выравнивания последовательностей (BWA и Bowtie), сборки генома (Velvet, Spades, IDBA-UD) и анализа вариантов (Freebayes, Mpileup, GATK). Удачи!
МэттДмо
If your motivation for asking the question is “I would like to participate in a discussion about ______”, then you should not be asking here.
Тем не менее, простой поиск в Google выдаст множество ссылок на идеи проектов, а также на сайты, где этот тип обсуждения будет по теме, например, Reddit или Quora. Удачи!Джеймс