Как РНК-полимераза "узнает" при rho-зависимой терминации у прокариот, что она достигла конца гена и что она должна остановиться, чтобы rho-фактор мог связать сайт мРНК колеи? Есть ли терминирующая последовательность на матричной ДНК, которая «сигнализирует» об окончании гена?
И, следовательно, как ро-фактор «узнает», когда связываться с мРНК?... как ро-фактор распознает, что РНК-полимераза остановилась, чтобы она могла начать свою АТФазную активность, чтобы отделить транскрипционный комплекс от ДНК и высвободить мРНК?
О прекращении синтеза молекулы РНК у бактерий сигнализирует также последовательность в матричной цепи молекулы ДНК.
Эта последовательность нуклеотидов в цепи матрицы представляет собой сайт паузы РНК-полимеразы . Когда РНКП продолжает свою транскрипцию, она достигает этого сайта и приостанавливает свою транскрипционную активность здесь. На продолжительность этой паузы также могут влиять различные факторы, такие как высокая
ионы в некоторых случаях.
Между тем, rho фактор, который после связывания с рут-сайтом, продолжает свою транслокацию по мРНК (предположим, что мРНК здесь синтезируется) в 5'-3' направлении, используя свою АТФазную активность. Фактор rho использует эту возможность, когда РНКП приостанавливает свою транскрипционную активность в месте паузы РНКП, чтобы достичь этого тройного комплекса элонгации транскрипции. Когда он достигает этого комплекса, он начинает свою АТФ-зависимую геликазную активность, которая разделяет гибридную спираль РНК-ДНК, вызывая высвобождение мРНК.
У прокариот транскрипция и трансляция происходят почти одновременно. Ниже трансляционного стоп-кодона существует C-богатый сайт на мРНК, называемый сайтом rho-утилизации (rut), и еще один сайт, называемый точкой остановки транскрипции (tsp).
Как РНК-полимераза узнает, что она достигла конца? РНК-полимераза останавливается в месте tsp во время транскрипции. Сайт рута функционирует как сайт загрузки мРНК, а также активирует rho-фактор. Активированный rho-фактор перемещается вниз по мРНК, все еще прикрепленный к месту колеи, и догоняет приостановленную РНК-полимеразу. Контакт с РНК-полимеразой приводит к тому, что РНК-полимераза отделяется от транскрипционного комплекса. Вы можете прочитать о диссоциации здесь, хотя статья находится за платным доступом .
Кажется, я ответил на вопрос "когда ро узнает?" слишком. Прочтите также статью в Википедии об этом
Миторон
П...
Варенье
П...
мдперри
Джаред Эндрюс