Все ли гены транскрибируются в дифференцированных клетках?

В моем учебнике говорится, что именно специфические факторы транскрипции позволяют разным наборам генов экспрессироваться в разных клетках (дифференциальная экспрессия генов). В моей книге приводится пример клеток печени и хрусталика: клетки печени содержат специфические транскрипционные факторы (СТФ) для активации энхансера гена альбумина, а клетки хрусталика содержат СТФ ​​для активации энхансера гена кристаллина. Клетки печени не имеют STF для активации гена кристаллина, а клетки хрусталика не могут активировать ген альбома.

Однако в моей книге также говорится, что существует базовый уровень транскрипции, возникающий в результате связывания общих факторов транскрипции. Энхансеры только увеличивают скорость транскрипции сверх этой базовой скорости. Означает ли это, что в дифференцированных клетках действительно транскрибируются все гены? Т.е. клетка хрусталика транскрибирует ген альбумина, а клетка печени транскрибирует ген кристаллина?

(Формулировка моей книги меня разубеждает: « Клетка печени : ген альбумина экспрессируется, а ген кристаллина — нет. Клетка хрусталика : ген кристаллина экспрессируется, а ген альбумина — нет».)

Теоретически да. Все они расшифрованы, но в следовых количествах. И поскольку гепатоцитам не нужен кристаллин, он может быть дегенерирован протеазами или преобразован в другой белок с помощью ER и телец Гольджи.
Нет, есть гены, которые полностью выключены. Например, наша текущая технология не может амплифицировать какие-либо транскрипты для обнаружения в секвенировании. Если вы выполните полную секвенирование РНК с высокой чувствительностью в разных типах клеток, вы обнаружите некоторые транскрипты, для которых в каждом типе нет прочтений (выше шума), и они будут представлять собой другой общий набор в зависимости от типа клеток. Кроме того, некоторые гены замолкают после развития. Это молчание обычно происходит за счет модификаций гистонов, которые полностью лишают транскрипционные факторы даже способности связываться с ДНК.
Этот ответ и упомянутая в нем статья могут ответить на ваш вопрос, если вам все еще не все равно после всех этих лет.

Ответы (2)

Нет Не все гены транскрибируются, белки- репрессоры и ядерные рецепторы могут связываться с ДНК, предотвращая транскрипцию определенных генов. Даже такие вещи, как регуляция гистонов, могут предотвратить транскрипцию. Может быть даже эпигенетическая регуляция транскрипции.

Источник 1

Источник 2

Я думаю, что гены транскрибируются, но либо мРНК не транслоируется (перемещается) в цитоплазму, либо не транслируется (возможно, деградирует). и если ваша процедура не имеет ошибок), но если вы сделаете вестерн-блоттинг, результат изменится, поскольку теперь мы видим вещи на уровне белка. Таким образом, несмотря на то, что все наши клетки имеют одинаковый состав генов в зависимости от ткани и органа, они имеют различный отбор РНК, поэтому они не будут тратить ресурсы на создание нежелательных белков.

Источник был бы важен, особенно для ответа «я думаю».
Извините, да, я должен был предоставить доказательства. Вы можете прочитать это в 6-м издании Гилберта по биологии развития, вот ссылка на книгу от NCBI ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK10112
Вы должны добавить, что это не ответ, я не могу изменить свой голос, если вы все равно не отредактируете его.