Это важный ген, экспрессируемый в E. coli , который подавляет SOS-ответ, а также экспрессию генов лямбда-литической фазы. УФ-излучение и повреждение ДНК ответственны за ее разрушение и, следовательно, за экспрессию генов репарации и, если они присутствуют, генов фага лямбда. Однако я не смог найти ссылку на его оригинальное название.
Я бы выбрал Lambda Excision A. Такие термины, как lex или rec , часто обозначают то, что можно было бы назвать мнемоникой, где, например, rec может обозначать рекомбинацию, а umu - УФ-мутатор. Соглашения об именах могут быть трудными.
Редактировать: В исследовании 1981 года, проведенном Роджером Брентом и Марком Пташне, отмечены некоторые данные из первоначальных исследований, которые показали, что репрессор lexA подавляет ряд генов, включая himA, которые, как они отмечают, необходимы для интеграции фага лямбда.
Согласно этому веб-сайту , это мнемоника для «вырезания лямбда». Я также нашел это использование в научной литературе (например, Harami et al., 2013). Однако ни один из этих источников ни на что не ссылается, и я не могу найти какой-либо определяющей статьи. Почти во всех статьях он упоминается просто как lexA.
Насколько я могу найти (трудно найти эти старые документы), вот как первоначально был описан локус (не обязательно ген) (Howard-Flanders and Boyce, 1966):
Существует ... локус, lex (локус для чувствительности к рентгеновскому излучению), в E. coli K-12 ... Мутация [A] в этом локусе увеличивает степень разрушения ДНК, вызванного УФ-излучением. Этот эффект аналогичен эффекту rec locus , но менее выражен.
Возможно, поскольку этот локус был лучше охарактеризован, название lex было сохранено для согласования с предыдущей литературой, но переопределено, чтобы отразить лучшее понимание его функции (хотя я не думаю, что «вырезание лямбда» делает это очень хорошо вообще).
использованная литература
Harami GM, Gyimesi M, Kovacs M. 2013. От ключей до бульдозеров: расширение роли доменов крылатых спиралей в белках, связывающих нуклеиновые кислоты. Тенденции Biochem Sci 38(7):364-371
Ховард-Фландерс П., Бойс Р.П. 1966. Восстановление ДНК и генетическая рекомбинация: исследования мутантов Escherichia coli , дефектных в этих процессах. Radiat Res Supp 6: 156-184
Ли Териот, чувствительный к рентгеновским лучам мутант https://thebradentontimes.com/lee-frances-theriot-p24426-154.htm В то время я был постдоком с Джозефом Гринбергом, работавшим в той же области.
Это хорошо задокументировано в Advances in Microbial Physiology , Volume 16, Moseley and Williams, страницы 116-117 (доступен для поиска через Google Books).
Маттерн и др. (1966) назвали мутации, делающие E. coli Bs-1 чувствительными к рентгеновскому излучению, мутациями exr (рентгеночувствительность). В том же году Howard-Flanders и Boyce (1966) независимо обозначили эквивалентные мутации в E. coli K-12 как lex (локус чувствительности к рентгеновскому излучению). В обоих штаммах эти мутации были близки к локусу malB ( b4039 ; lexA равен b4043 ). Год спустя Гринберг использовал более широкое обозначение с тем же каузальным корнем (Locis for Radiation Sensitivity) для обозначения этих же мутаций.
LexA также известен как umuA ( УФ-индукция мутаций ) и tsl ( термочувствительные мутации ).
тел
What does gene name X stand for?Я думаю, вы, возможно, ожидаете слишком многого от стандартных соглашений об именах...ваджра78
рхилл45
СКМ