Находятся ли эукариотические промоторы в районе 5'-UTR?

Мне было интересно, расположены ли промоторные последовательности в области 5'UTR в эукариотических организмах?

насколько я понимаю, UTR является частью мРНК (нетранслируемой области), тогда как промоторы являются частью ДНК, последовательностей, с которыми связывается ДНК-зависимая РНК-полимераза. Так что по определению промоутеры не могут быть в UTR. Более того, поскольку РНК Pol связывается с промотором, транскрибироваться может только часть последовательности промотора, если она вообще есть.

Ответы (2)

Большинство промоторных элементов не являются частью последовательности мРНК. Они расположены вверх по течению (в направлении 5') от сайта начала транскрипции. Однако определенный класс промоторов, называемых нижними промоторными элементами (DPE), может перекрываться с генной областью. Сообщалось, что эти элементы лежат на 29-33 п.н. выше сайта начала транскрипции и широко используются у дрозофилы [1] . Картирование DPEs также было выполнено для генов мыши и человека [2] . Однако подробный анализ, подкрепленный хорошими данными секвенирования, еще предстоит сделать.

Итак, хотя DPE присутствуют в транскрипте, я не уверен, сохраняются ли они в экзоне. Это может быть подтверждено картированием сайтов сплайсинга, но этот анализ не представлен в этих статьях.

На приведенном ниже рисунке [3] видно , что большинство первых экзонов у человека достаточно велики, чтобы вместить DPE.

введите описание изображения здесь

Я не думаю, что промоторные последовательности находятся в области 5'UTR. 5'-конец 5'UTR является местом начала транскрипции, и общий фактор транскрипции связывается непосредственно перед 5'-концом генома (примерно на 30–40 п.н. выше).

https://en.wikipedia.org/wiki/Promoter_(генетика)

Находятся ли эукариотические промоторы в районе 5'-UTR?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v