Как показывает этот вопрос, большинство аминокислот в организме человека имеют L-хиральность. Поскольку ферменты также обладают хиральностью, что происходит с D-аминокислотами, которые попадают в организм человека? Они просто выделяются? Существуют ли ферменты (возможно, не у человека), которые превращают D-аминокислоту в L-аминокислоту?
По большей части они не используются. существуют рацемазы аминокислот, которые взаимопревращают L- и D-формы некоторых специфических аминокислот, которые могут использоваться в некоторых конкретных биосинтетических или метаболических путях.
В частности, я имею в виду люциферазу светлячка, которая использует D-цистеин в качестве окислительно-восстановительного реагента для регенерации люциферинового субстрата, потребляемого светогенерирующим ферментом. см. слайд 4 здесь .
Нерибосомные пептидные синтазы также часто используют D-аминокислоты.
Однако я не верю, что d-аминокислоты действительно входят в состав белков.
Вас также может заинтересовать оксидаза D-аминокислот ( EC 1.4.3.3 ), флавопротеин (FAD), высокоспецифичный для D-формы аминокислот, который был открыт Гансом Кребсом в 1935 году (см. здесь ), и который имеет широкое распространение (в том числе и у человека).
Фермент был очень тщательно исследован, в частности, Мэсси и его сотрудниками (см. , например , здесь ).
Оксидаза D-аминокислот ( EC 1.4.3.3 ) катализирует реакцию, которая приводит к следующему превращению
D-аминокислота + H 2 O + O 2 = 2-оксокарбоксилат + NH 3 + H 2 O 2
2-оксокарбоксилаты — это то, что раньше называли α-кетокислотами. Например, пируват получают из D-Ala.
Продуктом ферментативной реакции является иминокислота, которая неферментативно гидролизуется до α-кетокислоты (см. Pollegioni et al ., 1994 и ссылки в нем).
Отличный обзор
Оксидаза D-аминокислот: физиологическая роль и применение
С.В.Хороненкова, В.И.Тишков,
Биохимия (Москва) в свободном доступе отсюда
Эти авторы могут рассказать много интересного о D-серине, D-пролине, D-аланине и многом другом.
Дополнительная ссылка
многие D-аминокислоты вообще не используются, хотя некоторые из них имеют довольно сложный метаболизм, как синтез, так и утилизацию: например, D-аланин.
Габриэль Фэйр
шигета