Что такое двухзаходная или зигзагообразная модель хроматинового волокна длиной 30 нм?

Из MB Info Wiki, на которую вы ссылались:

В модели одностартового соленоида изогнутая линкерная ДНК последовательно соединяет ядра каждой нуклеосомы, создавая структуру, в которой нуклеосомы следуют друг за другом по одному и тому же спиральному пути [4, 7]. В качестве альтернативы, в двухзаходной зигзагообразной модели ДНК с прямым линкером соединяет два противоположных ядра нуклеосом, создавая противоположные ряды нуклеосом, которые образуют так называемые «двухзаходные»? спираль.

Это означает, что в одностартовой модели каждая нуклеосома связана с соседней, и это непрерывный цикл. Это означает, что это больше похоже на телефонный аккорд.

Вместо этого модель Zig-Zag предполагает, что каждая нуклеосома связана с нуклеосомой примерно напротив нее (параллельно) и представляет собой структуру, непрерывную по всему хроматиновому волокну. Это сложнее понять, но представьте, что это больше похоже на шнуровку на ботинке. Он идет от отверстия на одной стороне к отверстию на другой стороне параллельно ему, но не в той же плоскости, что и он сам.

Чтобы перейти к третьей нуклеосоме (и упаковать ее как можно плотнее), вместо того, чтобы находиться прямо под 1-й нуклеосомой, она должна быть немного в стороне и не точно параллельна 2-й нуклеосоме.

Однако 4-я нуклеосома будет точно параллельна 3-й и, таким образом, будет смещена от центра 2-й нуклеосомы на такое же количество градусов, как 3-я нуклеосома относительно 1-й, сохраняя паттерн.

Это формирует более трехмерную трубчатую структуру, чем настоящий шнурок на ботинке (который более плоский, как плоскость, но служит визуальным ориентиром).

Пошаговое 2D-представление этого будет похоже на изображение ниже:

Вот модель окончательной фигуры, которую я сделал, чтобы помочь объяснить это:

На рисунке MBI каждая «зеленая» нуклеосома соединена с противоположной чуть более низкой «фиолетовой» нуклеосомой, а эта фиолетовая нуклеосома соединена с еще одной зеленой, которая немного смещена от центра первой зеленой нуклеосомы:

Теоретически (не уверен, что правильно): это может означать, что когда это волокно «разворачивается», оно будет действовать не так, как расстегивающаяся пружина (где вся структура начнет распутываться из-за того, как она связана), и вместо этого каждая последующая нуклеосома будет вытягиваться. от волокна после того, как тот, к которому оно подключено, переместится и испытает полное натяжение.

Для модели ZigZag представьте, что вы берете лист бумаги и складываете его много раз, как если бы это была гармошка. Затем держите сложенную бумагу в одной руке. Возьмите противоположную руку и потяните бумагу за один конец, медленно разворачивая ее. Вы заметите, что каждая складка выходит последовательно, в то время как остальная часть конструкции остается нетронутой до тех пор, пока складка перед ней не распрямится, чтобы натяжение могло ее тянуть. По крайней мере, это то, что произошло бы в моей голове. Я могу быть совершенно не в теме.