Ингибирование фермента альфа-2 макроглобулином

Давайте сначала посмотрим на правильное определение подавления самоубийства, данное Википедией (выделено мной):

В биохимии ингибирование суицида, также известное как суицидальная инактивация или механическое ингибирование, представляет собой необратимую форму ингибирования фермента, которая возникает, когда фермент связывается с$\alpha$аналог субстрата и образует с ним необратимый комплекс через ковалентную связь в ходе «нормальной» реакции катализа . Ингибитор связывается с активным центром, где он модифицируется ферментом с образованием реакционноспособной группы, которая необратимо реагирует с образованием стабильного комплекса ингибитор-фермент. При этом обычно используется простетическая группа или кофермент, образующий электрофильные альфа- и бета-ненасыщенные карбонильные соединения и имины.

Теперь давайте посмотрим, как$\alpha$-2-Макроглобулин работает, опять же из Википедии (выделено мной):

$\alpha$Ингибиторы М-протеазы ингибируют стерические затруднения . Механизм включает расщепление протеазой области-приманки, сегмента$\alpha$M, который особенно восприимчив к протеолитическому расщеплению, которое инициирует конформационные изменения, такие как$\alpha$М. разрушается о протеазу. В результате$\alpha$М-протеазный комплекс, активный центр протеазы стерически экранирован , что существенно снижает доступ к белковым субстратам. В результате расщепления области-приманки происходят два дополнительных события, а именно (i) сложный эфир h-цистеинил-g-глутамилтиола становится высокореакционноспособным и (ii) основное конформационное изменение обнажает консервативный COOH-концевой домен связывания рецептора (RBD). Воздействие RBD позволяет$\alpha$М-протеазный комплекс связывается с клиренсными рецепторами и удаляется из кровотока.

Таким образом, очевидно, что это не подавление самоубийства, поскольку:

• $\alpha$Ингибитор М-протеазы не образует необратимого комплекса с протеазой, вместо этого он использует стерические препятствия, чтобы предотвратить связывание протеазы с любым субстратом .
• это ингибирование не происходит во время «нормальной» реакции катализа, это происходит после того, как протеаза катализирует реакцию, которую ингибитор покрывает ее, что больше похоже на следствие катализа .
• ингибитор не связывается с активным центром протеазы, он покрывает активный центр как щит.

Putative mechanism of protease entrapment and inhibition by ECAM (Escherichia coli Alpha-2 Macroglobulin)

Использованная литература:

1. Ингибирование самоубийства
2. $\alpha$-2 Макроглобулин
3. Структура расщепленной протеазой Escherichia coli $\alpha$Макроглобулин -2 раскрывает предполагаемый механизм конформационной активации захвата протеазы (PDF)