Как определить, является ли человек гомозиготным по определенному аллелю?

Я подумывал начать небольшой частный исследовательский проект. В этом проекте мне нужно выяснить, является ли человек гомозиготным по определенному аллелю. Причина этого в том, что я действительно пытаюсь выяснить, есть ли мутация, которая заставляет его/ее не производить этот хемокин. Таким образом, мне нужно легко определить, какие люди являются «нормальными», у каких людей есть мутация в одной хромосоме, а у каких людей есть мутация в обеих. Около 1% населения имеют мутацию в обеих хромосомах.

Букварь, AFAIK, не сможет отличить гетерозиготных от «нормальных» людей.

Кто-нибудь знает, как к этому подойти?

вы можете использовать тестовый крест, но это может быть сложно :)
Не думаю, что у меня есть время разводить людей ;)

Ответы (1)

Вы можете использовать стратегию 3-х праймеров, где у вас есть общий праймер, один из которых амплифицирует только мутантный аллель, а другой амплифицирует только wt. Это может быть или не быть осуществимым в зависимости от типа мутации. ДНК гетерозиготных людей будет амплифицировать оба продукта, в то время как гомозиготные будут амплифицировать только один (wt или мутантный).

Конечно, тогда связать мутацию гена с отсутствием хемокина не обязательно просто.

Однако, если честно, я бы использовал другой подход: взять людей, которые не производят хемокин, и людей, которые производят (просто вводя хемокин в кровь). Теперь секвенируйте ген в двух группах и ищите мутации.

Да, это разумный подход. Но я не думаю (= не знаю, если) нефункциональный ген будет выглядеть одинаково у всех людей. Поскольку это мутация миссенс/нонсенс, она, вероятно, не имеет четкой характеристики. В любом случае, хорошая мысль! +1
@Pedery: ну, тогда разве секвенирование не будет лучшей стратегией в этом случае? Есть ли у вас какая-либо информация о мутации или ее продукте?
Не сейчас. Сейчас пытаюсь получить обзор. Секвенирование на самом деле не вариант, потому что я хочу превратить его в очень простой набор для тестирования, который не потребует дорогостоящего оборудования и позволит получить результат теста по простой капле крови. Но действительно, ваш ответ был полезен. Если я не получу лучших ответов, я отмечу ваш как принятый.
Кстати, какова будет цель общего праймера? Если у вас есть два других учебника для начинающих, они все равно расскажут вам всю необходимую информацию, верно?
Нет, вам нужно два праймера для ПЦР-амплификации. Если у вас есть только праймер, который идет на мутантный аллель, и тот, который идет на wt, у вас не будет возможности ничего амплифицировать, поскольку они никогда не будут связываться с одной и той же ДНК.
А, понял. Я думал о наборах из двух праймеров на аллель как об одном праймере.