Как решить, связаны ли гены в задаче неупорядоченного картирования?

Насколько я понимаю, если тетрады, полученные в результате скрещивания, имеют такое же количество родительских дитипов, как и неродительских дитипов, то рассматриваемые гены называются несцепленными.

Например, я скрещиваю две гаметы, содержащие а б + и а + б , соответственно, и получить 170 тетрад, проявляющих родительский дитип (все потомки а б + или а + б ), 165 с неродительским дитипом (потомство а + б + или а б ), и 30 проявляющих тетратип (потомство одного из а + б + , а + б , а б + или а б ).

Я не уверен, следует ли классифицировать эти гены как сцепленные или несцепленные. Я хочу сказать да, они действительно связаны, но 170 и 165 кажутся достаточно близкими числами, чтобы предположить, что они могут быть не связаны.

Я бы подумал, что отношение родительского дитипа к неродительскому должно считаться достаточно близким к 1, но как мы определяем порог для этого?

Ответы (1)

Я бы использовал критерий хи-квадрат. Вы вычисляете, что вы ожидаете увидеть, если ваша гипотеза верна, и вы берете то, что видите, и результат хи-квадрат говорит вам, насколько вероятно, что ваши результаты достаточно отличаются от ожидаемых, чтобы указать, что ваша гипотеза неверна.

Хорошо, это имеет смысл для меня. Есть ли способ узнать ожидаемое распределение генотипов тетрад?