Помогите со сцеплением и картированием генов!

Вот интересный вопрос, который я пытался выяснить:

введите описание изображения здесь введите описание изображения здесь

Мои аннотации выделены красным. На данный момент я выяснил:

  • Мы знаем, что 630 колоний выжили после посева антибиотиков ACD... это означает, что они приобрели аллели устойчивости a/c/d, но остались дикого типа для аллеля b. Генотип будет «a b + c d». Поскольку ТАКОЕ МНОГИЕ (630!) колонии, по-видимому, наследуют a/c/d вместе, а b совершенно отдельно от них, я бы сказал, что b — это ген, довольно далекий от трех других генов.

Однако я не знаю, как поступить и определить вероятный порядок трех других генов: a, c и d .

Вот моя догадка: B--------------------CDA .

Я объясню:

  • Ну, я посмотрел и увидел, что 942 (много!!!) собрали A/D вместе. Так что A/D, вероятно, соседние.

  • Затем 786 (много, но меньше) подхватили C/D вместе. Итак, C дальше от D, чем A далеко от D. Возникает вопрос: это «C---AD» или это «AD---C»?

  • Понимание приходит с 640 (еще меньше) подключенными кондиционерами вместе. Это означает, что A на самом деле довольно ДАЛЕКО от C, потому что большее расстояние = больше событий рекомбинации, которые могут их разделить. Таким образом, между «C---AD» или «AD---C», перечисленными выше, это, скорее всего, «AD---C».

  • Хорошо! Мы знаем, что B далеко от других, НО это как "B-------ADC", или как "ADC-------B"? Что ж, давайте посмотрим: взятые вместе B/C составляют 51, а взятые вместе A/B всего 46. Значит, A немного ДАЛЕЕ от B, чем C дальше от B, так как 46 < 51.

    • Это привело меня к моему предложенному ответу: что порядок "ADC---------B", или, если вы просто перевернете его, его эквивалент: "B---------CDA" .

Как мои рассуждения? Этот материал может быть довольно запутанным; подхожу ли я к нему с правильного угла? Спасибо; действительно ценю это!

Вам никогда не говорили, что все гены находятся на одной плазмиде. Я думаю, вы должны относиться ко всем этим счетчикам < 50 как к нулю; клетки практически никогда не получают и ACD, и B-плазмиду; они получают то или иное.

Ответы (1)

Я думаю, что ваши рассуждения верны, и ваш приказ весьма вероятен, но мне было бы неудобно решать, на стороне Б ли. На самом деле дело не только в этом: я думаю, что, используя в основном одно и то же число (~ 40) для всего, что включает B, они хотят, чтобы вы пришли к другому выводу.

В отличие от эукариотических клеток, подвергающихся мейозу, у бактерий нет кроссинговера, поглощающего ДНК из окружающей среды. Следовательно, ячейка не может наследовать A, B и C, но не D, который находится посередине. Просто, исходя из моего понимания «экспериментальной» установки, они добавили антибиотики A, B и C, поэтому они должны предположить, что бактерии относятся к дикому типу для D. Однако в основном наверняка, что эти ABC-резистентные колонии также являются D- стойкий.

Тем не менее, ваши рассуждения верны: сравнение BC и AB должно дать вам сторону B, поскольку разрыв мог быть внутри кластера из 3 генов. Однако числа очень близки, и фенотипы «AB» и «BC», вероятно, в любом случае являются ABCD, что делает небольшую разницу еще менее значимой (истинные AB и BC теряются, потому что они смешиваются со многими ABCD).

Помогите со сцеплением и картированием генов!
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v