Наиболее подходящий индекс биоразнообразия

Я провожу исследование влияния двух различных методов ухода за травой (выпас скота и машинное скашивание) на растительное биоразнообразие.

Я собрал свои данные, и теперь мне нужно обработать их таким образом, чтобы получить значимые и достоверные результаты. Мои данные представлены в виде 25 образцов на площадь с процентным содержанием, измеренным для каждого вида на площади 0,25 м 2 .

В настоящее время я использую нестандартный метод количественной оценки разнообразия, называемый индексом Диснея (который, как мне кажется, назван одноименно в честь RHL Disney, однако я не могу найти никаких ссылок, описывающих это), в котором мы присваиваем каждому виду вес. на основе процентного содержания, следующим образом:

                                           Таблица, показывающая веса для процентного содержания

Затем мы используем эти веса для расчета индекса следующим образом (т. е. путем вычисления суммы весов видов по количеству видов):

                                                                    введите описание изображения здесь

Я хочу знать, является ли это наилучшим индексом разнообразия, который я мог бы использовать для этого типа анализа, или есть другие, которые мне следует рассмотреть.

Заранее спасибо!

Ответы (4)

Похоже, вас интересует бета-разнообразие , то есть изменение состава таксонов (т. е. альфа-разнообразие) между участками. Существует несколько подходов к расчету бета-разнообразия, и правильный выбор обычно зависит от вопроса (вопросов), на который вы пытаетесь ответить. Наиболее распространенные подходы очень хорошо описаны в этой статье:

Андерсон, MJ и соавт. 2011. Навигация по множеству значений бета-разнообразия: дорожная карта для практикующего эколога. Письма об экологии 14:19-28

PS Я не знаком с индексом Диснея, поэтому не могу комментировать его достоинства.

PPS Вас также может заинтересовать этот вопрос .

Вы можете посмотреть статью Колеффа (открытый доступ @ JAE http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1365-2656.2003.00710.x/abstract ).

Учитывая, что у вас есть количественные данные, вы должны посмотреть на разницу между наличием/отсутствием и количественными показателями. Измерение Брай-Кертиса или что-то в этом роде было бы намного лучше, чем измерение Соренсена или Уиттакера, чтобы вы не потеряли информацию.

Я ничего не знаю об «индексе Диснея», но уравнение, которое вы используете, выглядит как версия D Симпсона, очень распространенного индекса биоразнообразия. Если вы просто оцениваете два разных типа сайтов (ваши две стратегии управления), я бы предложил метод разрежения. Это можно оценить либо в веганском пакете в R, либо в EstimateS http://viceroy.eeb.uconn.edu/EstimateS/ Роберта Колвелла. Редкость учитывает количество образцов, которые у вас есть, при расчете оценки количества найденных вами видов. Вы также можете использовать прямые оценки видового богатства, такие как Chao1 и Chao2. На мой взгляд, лучшим «индексом разнообразия» является PIE Херлберта.

Надеюсь это поможет.

Все остальные ответы абсолютно верны, и я с ними согласен. В вашем случае я бы не стал использовать индекс Диснея, поскольку у вас есть надежная пропорция изобилия, а Дисней обычно присваивает номер. Я думаю, что этот шаг может скрыть часть информации в данных. В вашем случае я бы использовал количественный коэффициент подобия.
Вы можете найти гораздо больше информации о коэффициенте сходства в этой книге « Численная экология» наряду с другими полезными анализами, такими как кластеризация.

Наиболее подходящий индекс биоразнообразия
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v